Arnaud Droit est professeur agrégé au Département de médecine moléculaire de la Faculté de médecine de l’Université Laval, et chercheur au Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, où il dirige la plateforme de bio-informatique et de protéomique. Il est aussi membre du bureau de direction du Centre de recherche en données massives (CRDM) de l’Université Laval. Arnaud Droit a fait ses études en biochimie et en bio-informatique à l’Université Toulouse III – Paul Sabatier, et est détenteur d’un doctorat de l’Université Laval. Le programme de recherche d’Arnaud Droit vise à développer de nouvelles approches et méthodes de génomique computationnelle, afin d’analyser efficacement et rigoureusement les données de génomique et de protéomique issues des technologies de nouvelle génération. Il est ainsi à la croisée des chemins entre les sciences biologiques et informatiques.

Depuis 2016, il est titulaire de la Chaire de recherche et d’innovation L’Oréal en biologie numérique, première chaire de recherche en biologie numérique, qui constitue un pôle d’excellence pour le développement de technologies et d’analyses de données multi-omiques massives (qui incluent les différents champs de la biologie se terminant par le suffixe « omique » : génomique, épigénomique, protéomique, métagénomique, etc.).

Le Dr Droit supervise plusieurs projets d’envergure, dont l’objectif est de résoudre les défis liés à la gestion de données massives et d’en extraire des connaissances exploitables pour la communauté des sciences de la vie. Un de ses projets vise à agréger de nombreuses sources de données biologiques, les relier entre elles, découvrir de nouvelles relations, et les rendre disponibles sur internet via des interfaces de visualisations dynamiques. Il est aussi impliqué dans le développement d’outils d’apprentissage machine dédiés à la recherche clinique et aux données multi-omiques, qui pourront aussi s’étendre dans d’autres domaines. D’autres projets couvrent aussi l’analyse de données multi-omiques temporelles, qui requièrent le développement de nouvelles approches, ou encore l’identification de gènes interagissant ensemble par l’intermédiaire de création de réseaux de co-expression.

Finalement, le Dr Droit a établi de nombreuses collaborations internationales qui lui permettent de couvrir plusieurs champs de recherche en biologie, notamment en oncologie, immunologie, et maladies de la peau.

CHUL
2705, boulevard Laurier
R-4720
Québec, Québec
Canada G1V 4G2
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Edeline PE, Leclercq M, Le Luyer J, Droit A, Chabrier S

3D microscopic reconstruction of pearls using combined optical microscopy and photogrammetry

Article de revue

Sci Rep, 14 (1), 2024.

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Mahdavi A, Leclercq M, Droit A, Rudkowska I, Lebel M

Predictive model for vitamin C levels in hyperinsulinemic individuals based on age, sex, waist circumference, low-density lipoprotein, and immune-associated serum proteins

Article de revue

J Nutr Biochem, 125 , 2024.

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Carrier M, Hui CW, Watters V, Šimončičová E, Picard K, González Ibáñez F, Vernoux N, Droit A, Desjardins M, Tremblay MÈ

Behavioral as well as hippocampal transcriptomic and microglial responses differ across sexes in adult mouse offspring exposed to a dual genetic and environmental challenge

Article de revue

Brain Behav Immun, 116 , 2024.

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Marroquín-Rivera A, Zhao C, Pessoni AM, Bherer J, Mansouri S, Droit A, Labonté B

Immune-related transcriptomic and epigenetic reconfiguration in BV2 cells after lipopolysaccharide exposure: an in vitro omics integrative study

Article de revue

Inflamm Res, 73 (2), 2024.

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Ganouna-Cohen G, Marcouiller F, Blachot-Minassian B, Demarest M, Beauparlant CJ, Droit A, Belaidi E, Bairam A, Joseph V

Loss of testosterone induces postprandial insulin resistance and increases the expression of the hepatic antioxidant flavin-containing monooxygenases in mice exposed to intermittent hypoxia

Article de revue

Acta Physiol (Oxf), 240 (3), 2024.

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Brodeur A, Roy V, Touzel-Deschênes L, Bianco S, Droit A, Fradette J, Ruel J, Gros-Louis F

Transcriptomic Analysis of Mineralized Adipose-Derived Stem Cell Tissues for Calcific Valve Disease Modelling

Article de revue

Int J Mol Sci, 25 (4), 2024.

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Allaeys I, Lemaire G, Leclercq M, Lacasse E, Fleury M, Dubuc I, Gudimard L, Puhm F, Tilburg J, Stone A, Machlus KR, Droit A, Flamand L, Boilard E

SARS-CoV-2 infection modifies the transcriptome of the megakaryocytes in the bone marrow

Article de revue

Blood Adv, 8 (11), 2024.

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Bergum OET, Singleton AH, Røst LM, Bodein A, Scott-Boyer MP, Rye MB, Droit A, Bruheim P, Otterlei M

SOS genes are rapidly induced while translesion synthesis polymerase activity is temporally regulated

Article de revue

Front Microbiol, 15 , 2024.

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Rouleau M, Villeneuve L, Allain EP, McCabe-Leroux J, Tremblay S, Nguyen Van Long F, Uchil A, Joly-Beauparlant C, Droit A, Guillemette C

Non-canonical transcriptional regulation of the poor prognostic factor UGT2B17 in chronic lymphocytic leukemic and normal B cells

Article de revue

BMC Cancer, 24 (1), 2024.

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Quitté L, Leclercq M, Prunier J, Scott-Boyer MP, Moroy G, Droit A

A Machine Learning Approach to Identify Key Residues Involved in Protein-Protein Interactions Exemplified with SARS-CoV-2 Variants

Article de revue

Int J Mol Sci, 25 (12), 2024.

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Projets actifs

  • Biomarkers for prediction of venous thrombo-embolism in children with cancer, du 2024-01-23 au 2024-12-31
  • Caractérisation de nouveaux gènes de susceptibilité au cancer du sein, du 2024-02-15 au 2027-04-01
  • Chaire de recherche et d'innovation l'Oréal en biologie numérique, du 2016-05-16 au 2026-05-15
  • Characterization of novel breast cancer susceptibility genes through large-scale targeted sequencing and functional assays., du 2024-04-01 au 2029-03-31
  • Covid-19 effects on ARTErial StIffness and vascular AgiNg (CARTESIAN) study- Canada, du 2021-06-01 au 2025-03-31
  • Delineation of the epigenomic principles underlying microglial transcriptional and cellular activity in chronic neurodegenerative diseases, du 2020-03-01 au 2025-03-31
  • Développement de nouvelles approches immunothérapeutiques dirigées contre des néoantigènes dérivés de gènes de fusion pour le traitement de la leucémie aiguë pédiatrique, du 2022-06-15 au 2025-06-14
  • Développement de nouvelles connaissances sur les cibles biologiques du 2-hexénal en vue de son utilisation comme bioherbicide, du 2023-03-15 au 2026-03-14
  • Développement de solutions diagnostiques pour les troubles neurodéveloppementaux causés par un dysfonctionnement du système Ubiquitine-Protéasome, du 2023-02-01 au 2026-01-31
  • Développement de stratégies d'apprentissage automatisées pour déterminer les phénogroupes, la progression et les issues cliniques de la sténose valvulaire aortique, du 2022-12-06 au 2024-09-30
  • Graph-based Natural Language Querying of Integrated Biological Knowledge Databases (KibioAI), du 2024-04-01 au 2029-03-31
  • Leveraging the impact of diversity in neurodevelopmental disability by integrating machine learning in personalized interventions, du 2020-02-01 au 2024-09-30
  • L’AIMZ-938, un nouveau promédicament anticancéreux pour le traitement des cancers du sein humain réfractaires aux traitements actuels et exprimant le cytochrome P450 1A1, du 2021-10-01 au 2026-09-30
  • MICROB-AI-R+, a new proteomics and AI-based technology for the detection of resistant pathogens in Urinary Tract Infections, du 2023-10-01 au 2025-09-30
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2025-03-31
  • Outil d'intelligence artificielle pour l'identification rapide et précise des bactéries pathogènes chez les animaux et/ou chez l'humain dans le lait et les produits laitiers, du 2021-04-01 au 2025-03-31
  • Outil d'intelligence artificielle pour l'identification rapide et précise des micro-organismes dans le lait, du 2022-03-24 au 2025-04-30
  • Personalized Risk Assesment for Prevention and Early Detection of Breast Cancer : Integration and Implementation (PERSPECTIVE II), du 2017-11-01 au 2025-09-30
  • Personalized ultra-fast detection and treatment of resistant microbial infections, du 2023-03-31 au 2025-03-30
  • Prevention of the immunopathology induced by SARS-CoV-2, du 2021-06-01 au 2025-03-31
  • Regenerative and Sustainable Agriculture for Climate Change Adaptation and Carbon Sequestration: Rebuilding Soil Health and Increasing Crop Productivity of Canadian Potato Production Systems, du 2023-04-01 au 2028-03-31
  • Role of megakaryocytes in Systemic Lupus Erythematosus, du 2023-04-01 au 2028-03-31
  • The interplay of sex hormones and chromosomes dictates pathogenicity in progressive CNS autoimmunity, du 2024-04-01 au 2029-03-31
  • Therapeutic approach to preserve Tfh cells and improve B cell immunity in simian immunodeficiency virus infected rhesus macaques, du 2021-04-01 au 2026-03-31

Projets terminés récemment

  • Artificial intelligence tool for fast and accurate identification of mastitis pathogenic and spoilage microorganisms in milk, du 2022-04-01 au 2024-03-31
  • Caractérisation de la structure 3D et de la coloration des perles chez Pinctada sp. par analyse d’image., du 2021-01-01 au 2024-06-30
  • Caribou Genomics : a National Non-Invasive Monitoring Approach for an Iconic and Model Species-at-Risk, du 2020-10-01 au 2023-09-30
  • Cellular mechanisms regulating the pathogenesis of secondary progressive CNS autoimmunity, du 2018-10-01 au 2023-03-31
  • Dévelooppement d'algorithmes d'interprétation de modèles d'apprentissage profond pour la découverte de biomarqueurs, du 2020-04-01 au 2024-05-31
  • Development of high accuracy models for MICROB-AI, a new generation of diagnosis test for UTI, du 2021-07-01 au 2024-06-30
  • Father's lasting influence: Molecular foundations of intergenerational transmission of the paternal environment, du 2014-11-01 au 2023-03-31
  • Identifying novel molecular insights from life science massive data, du 2018-04-01 au 2024-03-31
  • Influence de l’environnement leucémique dans le développement d’évènements thrombotiques chez les enfants atteints de leucémie lymphoblastique aigue traités dans l’essai thérapeutique international prospectif DFCI 16-001, du 2023-02-21 au 2024-03-31
  • Influence of hyperglycemia on the host-microbiome interactions during subgingival microbiome dysbiosis, du 2020-12-11 au 2023-06-10
  • Nouvelle approche intégrative de génomique du microbiome pour des luzernières plus durables, du 2022-07-01 au 2024-06-30
  • Nouvelle approche moléculaire pour la détection simultanée des virus pathogènes aux framboisiers et aux fraisiers, du 2019-08-01 au 2023-08-31
  • Predict to prevent: Advanced proteomics profiling for precision medicine, du 2021-03-23 au 2022-09-30
  • Une infrastructure IA multi-usagers clé en main pour gérer le cycle de vie complet des données en santé, du 2021-04-01 au 2024-06-30
  • Use of genomics to manage and protect caribou populations, du 2018-04-01 au 2022-12-31
  • Utilisation du séquençage à haut débit pour l’identification d’organismes pathogènes des plantes, du 2019-08-01 au 2023-08-31
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval