La modélisation moléculaire et la conception de médicaments assistée par ordinateur (CAAD) font désormais partie intégrante des projets de découverte de médicaments, que ce soit pour étudier les complexes protéine-ligand ou pour analyser les propriétés de molécules organiques. Le service de modélisation moléculaire bénéficie d’une collaboration avec le Dr Juan Francisco Cortés Benítez, qui a participé au cours des dernières années à divers projets de collaboration avec des membres du CHU qui ont abouti à des publications. 

 Expertises : 

  • Modélisation d’homologie et identification de sites de liaison.
  • Amarrage moléculaire à l’aveugle, amarrage Site-spécifique et criblage virtuel par amarrage moléculaire.
  • Prédiction des propriétés physicochimiques et ADME-Tox de petites molécules. 
  • Simulations de dynamique moléculaire des complexes Protéine-Ligand (y compris ceux impliquant des protéines membranaires).
  • Calculs de structures électroniques par théorie fonctionnelle de la densité (DFT).
  • Analyse/alignement des séquences primaires, prédiction de la structure des protéines secondaires et tertiaires.
  • Mécanique quantique (QM) et calculs hybrides quantiques/classiques (QM/MM). 
  • Modélisation QSAR et QSPR.