L’Orbitrap Fusion Tribrid (Thermo Fisher Scientific) est un spectromètre de masse qui associe trois analyseurs différents : un quadrupole (permet une sélection efficace des ions), une trappe linéaire (permet une détection rapide des spectres de fragmentation) et un Orbitrap (permet une mesure très précise des masses grâce à sa très haute résolution allant jusqu’à 450K).
Outre la fragmentation classique de type CID, ce spectromètre de masse est également capable de réaliser d’autres types de fragmentation des peptides grâce à sa cellule HCD (particulièrement utile pour les quantifications de type TMT) et à sa source ETD plus efficace pour l’identification des modifications post-traductionnelles comme les phosphorylations, glycosylations, etc.
Cet instrument est couplé à un système de chromatographie liquide à ultra haute pression (jusqu’à 800 bars) U3000 RSLC nano (Thermo Fisher Scientific) et à un système de mobilité ionique FAIMS Pro permettant la réduction de bruit de fond dans les spectres.
Bien qu’il s’agisse d’un instrument plus ancien que les autres instruments de la plateforme sa précision et sa polyvalence font de l’Orbitrap Fusion un instrument de choix pour les analyses de modifications post-traductionnelles (PTMs) ou de complexes protéiques (immunoprécipitations, pull-downs).