Le Dr Samer Hussein est chercheur au Centre de Recherche du CHU de Québec – Université Laval, dans le groupe St-Patrick de recherche en oncologie fondamentale. Il est également professeur adjoint au département de biologie moléculaire, biochimie médicale et pathologie de la Faculté de médecine, Université Laval.

Ses travaux de recherche visent à comprendre les mécanismes moléculaires qui établissent et régulent les états cellulaires pluripotents, particulièrement le rôle des ARN longs non-codants dans les réseaux géniques, ainsi que les événements transcriptionnels responsables de l’initiation et de la progression du cancer.

Définir les réseaux de gènes et leurs interactions contrôlant les états pluripotents
La pluripotence se définit comme la faculté d’une cellule à générer tous les types cellulaires d’un organisme. Les trois facteurs de transcription Oct4, Sox2, et Nanog représentent les piliers centraux du réseau de régulation des gènes associé au maintien d’un état pluripotent. Grâce à des modèles cellulaires de pluripotence et de reprogrammation ainsi qu’à l’utilisation de technologies à haut débit (protéomique, RNA-seq et ChIP-seq), ce projet a pour but de comprendre comment les interactions entre les facteurs de transcription de pluripotence et les régulateurs de la chromatine déterminent le destin cellulaire et la transition des cellules vers des lignées spécifiques dans le développement embryonnaire ainsi que celui du cancer.

Définir le rôle de certains ARN longs non-codants dans l’identité cellulaire
Les ARN longs non-codants (lncRNA) constituent une classe à part entière d’ARN, caractérisés par le fait qu’ils ne codent pour aucune protéine connue et qu’ils sont composés d’au moins 200 paires de bases. Les lncRNA ont été impliqués dans la régulation génique et le maintien de l’identité cellulaire, mais leur mécanisme d’action impliqué dans l’établissement de la pluripotence demeure inconnu. L’objectif de ce projet est de comprendre le rôle des lncRNAs dans la régulation des états pluripotents et la reprogrammation des cellules souches embryonnaires.

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A CRISPR-Cas9 screen identifies EXO1 as a formaldehyde resistance gene

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Highly efficient reprogrammable mouse lines with integrated reporters to track the route to pluripotency

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Khelifi G, Chow T, Whiteley J, Fort V, Humphreys BD, Hussein SMI, Rogers IM

Determining epigenetic memory in kidney proximal tubule cell derived induced pluripotent stem cells using a quadruple transgenic reprogrammable mouse

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Prostate cancer resistance leads to a global deregulation of translation factors and unconventional translation

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Devoucoux M, Fort V, Khelifi G, Xu J, Alerasool N, Galloy M, Wong N, Bourriquen G, Fradet-Turcotte A, Taipale M, Hope K, Hussein SMI, Côté J

Oncogenic ZMYND11-MBTD1 fusion protein anchors the NuA4/TIP60 histone acetyltransferase complex to the coding region of active genes

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MRG Proteins Are Shared by Multiple Protein Complexes With Distinct Functions

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Pan-cancer analysis of non-coding transcripts reveals the prognostic onco-lncRNA HOXA10-AS in gliomas

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Long non-coding RNAs and transposable elements: A functional relationship

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Khelifi G, Hussein SMI

A New View of Genome Organization Through RNA Directed Interactions

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Projets actifs

  • Conférence Signalisation Québec 2022, du 2022-06-01 au 2023-05-31
  • Direct lineage reprogramming of astrocytes to new oligodendrocytes for the treatment of demyelinating disease, du 2022-04-01 au 2025-01-31
  • Exploration des interactions fonctionnelles des longs ARNs non-codants dans le développement embryonnaire et le cancer, du 2022-07-01 au 2025-06-30
  • Repairing the dopaminergic circuits in Parkinson disease using synucleinopathy resistant neurones grafting, du 2022-04-01 au 2024-03-31
  • Unraveling the functional domains of a novel pluripotency-associated lncRNA, du 2023-04-01 au 2028-03-31

Projets terminés récemment

  • Étude de criblage sur la reprogrammation du métabolisme, du micro-environnement tumoral et des cellules souches cancéreuses dans le médulloblastome, du 2021-05-01 au 2022-04-30
  • Les réseaux d’interactions moléculaires dans les états de pluripotence différents, du 2017-07-01 au 2021-06-30
  • The role of long non-coding RNAs in defining pluripotent stem cell states, du 2017-04-01 au 2022-03-31
  • Transcription factor stoichiometry defines distinct pluripotent states, du 2016-04-01 au 2023-03-31
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