Jacques Côté a obtenu son doctorat à l’Université Laval après avoir caractérisé la structure et la fonction d’Endo G, une endonucléase impliquée dans la réplication de l’ADN mitochondrial et de l’apoptose cellulaire. Il a fait par la suite une formation postdoctorale avec le Dr Jerry Workman à Penn State University, où il a identifié et caractérisé les complexes de remodelage de la chromatine (SWI/SNF) impliqués dans l’activation des gènes. En 1997, il a rejoint l’Université Laval où il est actuellement professeur titulaire au département de biologie moléculaire, biochimie médicale et pathologie, détenant la Chaire de recherche du Canada en biologie de la chromatine et épigénétique moléculaire. Ses projets de recherche caractérisent le rôle dynamique de la chromatine dans la régulation des fonctions nucléaires et la prolifération cellulaire. Son travail utilise le système modèle de levure ainsi que les cellules humaines pour définir la structure, la fonction et la régulation des complexes modifiant les histones, impliqués dans l’expression et le maintien du génome. La recherche dans son laboratoire a conduit à d’importantes découvertes sur les mécanismes de régulation de la transcription des gènes, et la réponse cellulaire aux dommages sur l’ADN, en utilisant une expertise en biologie et génétique moléculaire, biochimie, épigénétique, génomique, protéomique et édition du génome.

Les travaux du laboratoire Côté visent à comprendre la dynamique de la chromatine en lien avec la régulation de l’expression des gènes, la réparation des dommages sur l’ADN et la réplication. Ils étudient des complexes multiprotéiques qui contrôlent l’acétylation et la méthylation des histones et la composition de la chromatine. Ils dissèquent les mécanismes moléculaires de l’épigénétique, au cours desquels des signaux envoyés à la chromatine identifient différentes régions du génome et sont lus par des effecteurs, traduisant une réponse biologique. Ce travail a caractérisé la structure et la fonction de plusieurs complexes protéiques, identifiant leurs modules intrinsèques de reconnaissance de signatures épigénétiques des histones. Des découvertes du laboratoire ont identifié et caractérisé en détails le complexe acétyltransférase hautement conservé NuA4/TIP60 et démontré pour la première fois le rôle essentiel d’activités modifiant la chromatine dans les processus de réparation et réplication de l’ADN chez les eucaryotes. La bonne écriture et lecture de ces marques épigénétiques conduit à des changements dans la dynamique chromatinienne, de manière ciblée dans le génome, et ce processus est perturbé dans le cancer. En fait, la grande majorité des activités étudiées par le laboratoire Côté sont des suppresseurs de tumeur et Tip60 lui-même est dérégulé dans un très large spectre de cancers.

L'Hôtel-Dieu de Québec
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Lu PYT, Kirlin AC, Aristizabal MJ, Brewis HT, Lévesque N, Setiaputra DT, Avvakumov N, Benschop JJ, Groot Koerkamp M, Holstege FCP, Krogan NJ, Yip CK, Côté J, Kobor MS

A balancing act: interactions within NuA4/TIP60 regulate picNuA4 function in Saccharomyces cerevisiae and humans

Article de revue

Genetics, 222 (3), 2022.

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Sudarshan D, Avvakumov N, Lalonde ME, Alerasool N, Joly-Beauparlant C, Jacquet K, Mameri A, Lambert JP, Rousseau J, Lachance C, Paquet E, Herrmann L, Thonta Setty S, Loehr J, Bernardini MQ, Rouzbahman M, Gingras AC, Coulombe B, Droit A, Taipale M, Doyon Y, Côté J

Recurrent chromosomal translocations in sarcomas create a megacomplex that mislocalizes NuA4/TIP60 to Polycomb target loci

Article de revue

Genes Dev, 36 (11-12), 2022.

Résumé | Liens:

Vann KR, Acharya A, Jang SM, Lachance C, Zandian M, Holt TA, Smith AL, Pandey K, Durden DL, El-Gamal D, Côté J, Byrareddy SN, Kutateladze TG

Binding of the SARS-CoV-2 envelope E protein to human BRD4 is essential for infection

Article de revue

Structure, 30 (9), 2022.

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Devoucoux M, Fort V, Khelifi G, Xu J, Alerasool N, Galloy M, Wong N, Bourriquen G, Fradet-Turcotte A, Taipale M, Hope K, Hussein SMI, Côté J

Oncogenic ZMYND11-MBTD1 fusion protein anchors the NuA4/TIP60 histone acetyltransferase complex to the coding region of active genes

Article de revue

Cell Rep, 39 (11), 2022.

Résumé | Liens:

Devoucoux M, Roques C, Lachance C, Lashgari A, Joly-Beauparlant C, Jacquet K, Alerasool N, Prudente A, Taipale M, Droit A, Lambert JP, Hussein SMI, Côté J

MRG Proteins Are Shared by Multiple Protein Complexes With Distinct Functions

Article de revue

Mol Cell Proteomics, 21 (7), 2022.

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Lashgari A, Kougnassoukou Tchara PE, Lambert JP, Côté J

New insights into the DNA repair pathway choice with NuA4/TIP60

Article de revue

DNA Repair (Amst), 113 , 2022.

Résumé | Liens:

Barry RM, Sacco O, Mameri A, Stojaspal M, Kartsonis W, Shah P, De Ioannes P, Hofr C, Côté J, Sfeir A

Rap1 regulates TIP60 function during fate transition between two-cell-like and pluripotent states

Article de revue

Genes Dev, 36 (5-6), 2022.

Résumé | Liens:

Bieluszewski T, Sura W, Dziegielewski W, Bieluszewska A, Lachance C, Kabza M, Szymanska-Lejman M, Abram M, Wlodzimierz P, De Winne N, De Jaeger G, Sadowski J, Côté J, Ziolkowski PA

NuA4 and H2A.Z control environmental responses and autotrophic growth in Arabidopsis

Article de revue

Nat Commun, 13 (1), 2022.

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Galloy M, Lachance C, Cheng X, Distéfano-Gagné F, Côté J, Fradet-Turcotte A

Approaches to Study Native Chromatin-Modifying Complex Activities and Functions

Article de revue

Front Cell Dev Biol, 9 , 2021.

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Ahmad S, Côté V, Côté J

DNA Damage-Induced Phosphorylation of Histone H2A at Serine 15 Is Linked to DNA End Resection

Article de revue

Mol Cell Biol, 41 (12), 2021.

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Projets actifs

  • Defining nucleosome features regulating the function of chromatin modifiers and remodelers, du 2022-04-01 au 2027-03-31
  • Functional analysis of the NuA4/TIP60 complex in epigenetic mechanisms linked to genome expression and stability, du 2022-03-01 au 2027-03-31
  • Functional analysis of the NuA4/TIP60 complex in epigenetic mechanisms linked to genome expression and stability, du 2022-10-01 au 2027-09-30
  • Plateforme de culture cellulaire pour l'analyse fonctionnelle de modificateurs épigénétiques liés aux maladies humaines, du 2022-04-01 au 2023-09-28
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  • Tetrahymena thermophila - un model évolutionnaire divergent pour découvrir de nouveau modes de régulation transcriptionnelle, du 2022-03-15 au 2025-03-14
  • Understanding the molecular determinants of high-grade endometrial stromal sarcomas, du 2022-09-01 au 2024-08-31

Projets terminés récemment

  • Chaire de recherche du Canada en biologie de la chromatine et épigénétique moléculaire, du 2015-01-01 au 2021-12-31
  • Control of Genome Expression and Maintenance by MYST-ING Tumor Suppressor Complexes., du 2015-07-01 au 2022-06-30
  • Gene Application to engage a Model Organism Researcher – ING3, du 2021-09-01 au 2022-08-31
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