Les images en fluorescence sont obtenues par des microscopes équipés d’un numériseur. Nos algorithmes d’analyse tirent profit de la séparation des signaux enregistrés dans chaque canal de l’image (un signal de fluorescence par canal). Chaque canal est nettoyé du bruit de fond et l’effet d’ombrage dans les tuiles des images est normalisé. L’évaluation de l’intensité du signal devient plus précise. Après la détection des objets d’intérêt, ils sont mesurés par un ou plusieurs modèles mathématiques appropriés et éventuellement filtrés selon des critères (taille, colocalisation, facteur de forme, intensité, …). En microscopie intravitale, la vidéo est stabilisée sur tous les canaux avant d’analyser la cinématique (trajectoires) des objets d’intérêts.
Le processus global d’analyse traite un lot entier d’images sans intervention manuelle et produit une table structurée de résultats rapportant mesures et facteurs de l’expérience directement utilisable par les logiciels d’analyse statistique.