Le Dr Samer Hussein est chercheur au Centre de Recherche du CHU de Québec – Université Laval, dans le groupe St-Patrick de recherche en oncologie fondamentale. Il est également professeur adjoint au département de biologie moléculaire, biochimie médicale et pathologie de la Faculté de médecine, Université Laval.

Ses travaux de recherche visent à comprendre les mécanismes moléculaires qui établissent et régulent les états cellulaires pluripotents, particulièrement le rôle des ARN longs non-codants dans les réseaux géniques, ainsi que les événements transcriptionnels responsables de l’initiation et de la progression du cancer.

Définir les réseaux de gènes et leurs interactions contrôlant les états pluripotents
La pluripotence se définit comme la faculté d’une cellule à générer tous les types cellulaires d’un organisme. Les trois facteurs de transcription Oct4, Sox2, et Nanog représentent les piliers centraux du réseau de régulation des gènes associé au maintien d’un état pluripotent. Grâce à des modèles cellulaires de pluripotence et de reprogrammation ainsi qu’à l’utilisation de technologies à haut débit (protéomique, RNA-seq et ChIP-seq), ce projet a pour but de comprendre comment les interactions entre les facteurs de transcription de pluripotence et les régulateurs de la chromatine déterminent le destin cellulaire et la transition des cellules vers des lignées spécifiques dans le développement embryonnaire ainsi que celui du cancer.

Définir le rôle de certains ARN longs non-codants dans l’identité cellulaire
Les ARN longs non-codants (lncRNA) constituent une classe à part entière d’ARN, caractérisés par le fait qu’ils ne codent pour aucune protéine connue et qu’ils sont composés d’au moins 200 paires de bases. Les lncRNA ont été impliqués dans la régulation génique et le maintien de l’identité cellulaire, mais leur mécanisme d’action impliqué dans l’établissement de la pluripotence demeure inconnu. L’objectif de ce projet est de comprendre le rôle des lncRNAs dans la régulation des états pluripotents et la reprogrammation des cellules souches embryonnaires.

L'Hôtel-Dieu de Québec
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Hussein SM, Puri MC, Tonge PD, Benevento M, Corso AJ, Clancy JL, Mosbergen R, Li M, Lee DS, Cloonan N, Wood DL, Munoz J, Middleton R, Korn O, Patel HR, White CA, Shin JY, Gauthier ME, Cao KA, Kim JI, Mar JC, Shakiba N, Ritchie W, Rasko JE, Grimmond SM, Zandstra PW, Wells CA, Preiss T, Seo JS, Heck AJ, Rogers IM, Nagy A

Corrigendum: Genome-wide characterization of the routes to pluripotency

Article de revue

Nature, 523 (7562), 2015.

| Liens:

Tonge PD, Corso AJ, Monetti C, Hussein SM, Puri MC, Michael IP, Li M, Lee DS, Mar JC, Cloonan N, Wood DL, Gauthier ME, Korn O, Clancy JL, Preiss T, Grimmond SM, Shin JY, Seo JS, Wells CA, Rogers IM, Nagy A

Corrigendum: Divergent reprogramming routes lead to alternative stem-cell states

Article de revue

Nature, 523 (7562), 2015.

| Liens:

Lee DS, Shin JY, Tonge PD, Puri MC, Lee S, Park H, Lee WC, Hussein SM, Bleazard T, Yun JY, Kim J, Li M, Cloonan N, Wood D, Clancy JL, Mosbergen R, Yi JH, Yang KS, Kim H, Rhee H, Wells CA, Preiss T, Grimmond SM, Rogers IM, Nagy A, Seo JS

An epigenomic roadmap to induced pluripotency reveals DNA methylation as a reprogramming modulator

Article de revue

Nat Commun, 5 , 2014.

Résumé | Liens:

Clancy JL, Patel HR, Hussein SM, Tonge PD, Cloonan N, Corso AJ, Li M, Lee DS, Shin JY, Wong JJ, Bailey CG, Benevento M, Munoz J, Chuah A, Wood D, Rasko JE, Heck AJ, Grimmond SM, Rogers IM, Seo JS, Wells CA, Puri MC, Nagy A, Preiss T

Small RNA changes en route to distinct cellular states of induced pluripotency

Article de revue

Nat Commun, 5 , 2014.

Résumé | Liens:

Benevento M, Tonge PD, Puri MC, Hussein SM, Cloonan N, Wood DL, Grimmond SM, Nagy A, Munoz J, Heck AJ

Proteome adaptation in cell reprogramming proceeds via distinct transcriptional networks

Article de revue

Nat Commun, 5 , 2014.

Résumé | Liens:

Michael IP, Westenskow PD, Hacibekiroglu S, Greenwald AC, Ballios BG, Kurihara T, Li Z, Warren CM, Zhang P, Aguilar E, Donaldson L, Marchetti V, Baba T, Hussein SM, Sung HK, Iruela-Arispe ML, Rini JM, van der Kooy D, Friedlander M, Nagy A

Local acting Sticky-trap inhibits vascular endothelial growth factor dependent pathological angiogenesis in the eye

Article de revue

EMBO Mol Med, 6 (5), 2014.

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Laurila K, Autio R, Kong L, Narva E, Hussein S, Otonkoski T, Lahesmaa R, Lahdesmaki H

Integrative genomics and transcriptomics analysis of human embryonic and induced pluripotent stem cells

Article de revue

BioData Min, 7 (1), 2014.

Résumé | Liens:

Tonge PD, Corso AJ, Monetti C, Hussein SM, Puri MC, Michael IP, Li M, Lee DS, Mar JC, Cloonan N, Wood DL, Gauthier ME, Korn O, Clancy JL, Preiss T, Grimmond SM, Shin JY, Seo JS, Wells CA, Rogers IM, Nagy A

Divergent reprogramming routes lead to alternative stem-cell states

Article de revue

Nature, 516 (7530), 2014.

Résumé | Liens:

Hussein SM, Puri MC, Tonge PD, Benevento M, Corso AJ, Clancy JL, Mosbergen R, Li M, Lee DS, Cloonan N, Wood DL, Munoz J, Middleton R, Korn O, Patel HR, White CA, Shin JY, Gauthier ME, Le Cao KA, Kim JI, Mar JC, Shakiba N, Ritchie W, Rasko JE, Grimmond SM, Zandstra PW, Wells CA, Preiss T, Seo JS, Heck AJ, Rogers IM, Nagy A

Genome-wide characterization of the routes to pluripotency

Article de revue

Nature, 516 (7530), 2014.

Résumé | Liens:

Carlsson E, Krohn K, Ovaska K, Lindberg P, Hayry V, Maliniemi P, Lintulahti A, Korja M, Kivisaari R, Hussein S, Sarna S, Niiranen K, Hautaniemi S, Haapasalo H, Ranki A

Neuron navigator 3 alterations in nervous system tumors associate with tumor malignancy grade and prognosis

Article de revue

Genes Chromosomes Cancer, 52 (2), 2013.

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Projets actifs

  • Conférence Signalisation Québec 2022, du 2022-06-01 au 2023-05-31
  • Direct lineage reprogramming of astrocytes to new oligodendrocytes for the treatment of demyelinating disease, du 2022-04-01 au 2025-01-31
  • Exploration des interactions fonctionnelles des longs ARNs non-codants dans le développement embryonnaire et le cancer, du 2022-07-01 au 2025-06-30
  • Repairing the dopaminergic circuits in Parkinson disease using synucleinopathy resistant neurones grafting, du 2022-04-01 au 2024-03-31
  • Transcription factor stoichiometry defines distinct pluripotent states, du 2016-04-01 au 2023-03-31

Projets terminés récemment

  • Étude de criblage sur la reprogrammation du métabolisme, du micro-environnement tumoral et des cellules souches cancéreuses dans le médulloblastome, du 2021-05-01 au 2022-04-30
  • Les réseaux d’interactions moléculaires dans les états de pluripotence différents, du 2017-07-01 au 2021-06-30
  • The role of long non-coding RNAs in defining pluripotent stem cell states, du 2017-04-01 au 2022-03-31
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