Jacques Côté a obtenu son doctorat à l’Université Laval après avoir caractérisé la structure et la fonction d’Endo G, une endonucléase impliquée dans la réplication de l’ADN mitochondrial et de l’apoptose cellulaire. Il a fait par la suite une formation postdoctorale avec le Dr Jerry Workman à Penn State University, où il a identifié et caractérisé les complexes de remodelage de la chromatine (SWI/SNF) impliqués dans l’activation des gènes. En 1997, il a rejoint l’Université Laval où il est actuellement professeur titulaire au département de biologie moléculaire, biochimie médicale et pathologie, détenant la Chaire de recherche du Canada en biologie de la chromatine et épigénétique moléculaire. Ses projets de recherche caractérisent le rôle dynamique de la chromatine dans la régulation des fonctions nucléaires et la prolifération cellulaire. Son travail utilise le système modèle de levure ainsi que les cellules humaines pour définir la structure, la fonction et la régulation des complexes modifiant les histones, impliqués dans l’expression et le maintien du génome. La recherche dans son laboratoire a conduit à d’importantes découvertes sur les mécanismes de régulation de la transcription des gènes, et la réponse cellulaire aux dommages sur l’ADN, en utilisant une expertise en biologie et génétique moléculaire, biochimie, épigénétique, génomique, protéomique et édition du génome.

Les travaux du laboratoire Côté visent à comprendre la dynamique de la chromatine en lien avec la régulation de l’expression des gènes, la réparation des dommages sur l’ADN et la réplication. Ils étudient des complexes multiprotéiques qui contrôlent l’acétylation et la méthylation des histones et la composition de la chromatine. Ils dissèquent les mécanismes moléculaires de l’épigénétique, au cours desquels des signaux envoyés à la chromatine identifient différentes régions du génome et sont lus par des effecteurs, traduisant une réponse biologique. Ce travail a caractérisé la structure et la fonction de plusieurs complexes protéiques, identifiant leurs modules intrinsèques de reconnaissance de signatures épigénétiques des histones. Des découvertes du laboratoire ont identifié et caractérisé en détails le complexe acétyltransférase hautement conservé NuA4/TIP60 et démontré pour la première fois le rôle essentiel d’activités modifiant la chromatine dans les processus de réparation et réplication de l’ADN chez les eucaryotes. La bonne écriture et lecture de ces marques épigénétiques conduit à des changements dans la dynamique chromatinienne, de manière ciblée dans le génome, et ce processus est perturbé dans le cancer. En fait, la grande majorité des activités étudiées par le laboratoire Côté sont des suppresseurs de tumeur et Tip60 lui-même est dérégulé dans un très large spectre de cancers.

L'Hôtel-Dieu de Québec
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Zhang H, Devoucoux M, Song X, Li L, Ayaz G, Cheng H, Tempel W, Dong C, Loppnau P, Cote J, Min J

Structural Basis for EPC1-Mediated Recruitment of MBTD1 into the NuA4/TIP60 Acetyltransferase Complex

Article de revue

Cell Rep, 30 (12), 2020.

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Fages J, Chailleux C, Humbert J, Jang SM, Loehr J, Lambert JP, Cote J, Trouche D, Canitrot Y

JMJD6 participates in the maintenance of ribosomal DNA integrity in response to DNA damage

Article de revue

PLoS Genet, 16 (6), 2020.

Résumé | Liens:

Humbert J, Salian S, Makrythanasis P, Lemire G, Rousseau J, Ehresmann S, Garcia T, Alasiri R, Bottani A, Hanquinet S, Beaver E, Heeley J, Smith ACM, Berger SI, Antonarakis SE, Yang XJ, Cote J, Campeau PM

De Novo KAT5 Variants Cause a Syndrome with Recognizable Facial Dysmorphisms, Cerebellar Atrophy, Sleep Disturbance, and Epilepsy

Article de revue

Am J Hum Genet, 107 (3), 2020.

Résumé | Liens:

Horikoshi N, Sharma D, Leonard F, Pandita RK, Charaka VK, Hambarde S, Horikoshi NT, Gaur Khaitan P, Chakraborty S, Cote J, Godin B, Hunt CR, Pandita TK

Pre-existing H4K16ac levels in euchromatin drive DNA repair by homologous recombination in S-phase

Article de revue

Commun Biol, 2 , 2019.

Résumé | Liens:

Klein BJ, Jang SM, Lachance C, Mi W, Lyu J, Sakuraba S, Krajewski K, Wang WW, Sidoli S, Liu J, Zhang Y, Wang X, Warfield BM, Kueh AJ, Voss AK, Thomas T, Garcia BA, Liu WR, Strahl BD, Kono H, Li W, Shi X, Côté J, Kutateladze TG

Histone H3K23-specific acetylation by MORF is coupled to H3K14 acylation

Article de revue

Nat Commun, 10 (1), 2019.

Résumé | Liens:

Ducy M, Sesma-Sanz L, Guitton-Sert L, Lashgari A, Gao Y, Brahiti N, Rodrigue A, Margaillan G, Caron MC, Cote J, Simard J, Masson JY

The Tumor Suppressor PALB2: Inside Out

Article de revue

Trends Biochem Sci, 44 (3), 2019.

Résumé | Liens:

Kollenstart L, de Groot AJL, Janssen GMC, Cheng X, Vreeken K, Martino F, Cote J, van Veelen PA, van Attikum H

Gcn5 and Esa1 function as histone crotonyltransferases to regulate crotonylation-dependent transcription

Article de revue

J Biol Chem, 294 (52), 2019.

Résumé | Liens:

Lashgari A, Lambert JP, Cote J

Measurement and Analysis of Lysine Acetylation by KAT Complexes In Vitro and In Vivo

Article de revue

Methods Mol Biol, 1983 , 2019.

Résumé | Liens:

Wang X, Ahmad S, Zhang Z, Cote J, Cai G

Architecture of the Saccharomyces cerevisiae NuA4/TIP60 complex

Article de revue

Nat Commun, 9 (1), 2018.

Résumé | Liens:

Clouaire T, Rocher V, Lashgari A, Arnould C, Aguirrebengoa M, Biernacka A, Skrzypczak M, Aymard F, Fongang B, Dojer N, Iacovoni JS, Rowicka M, Ginalski K, Côté J, Legube G

Comprehensive Mapping of Histone Modifications at DNA Double-Strand Breaks Deciphers Repair Pathway Chromatin Signatures

Article de revue

Mol Cell, 72 (2), 2018.

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Projets actifs

  • Defining nucleosome features regulating the function of chromatin modifiers and remodelers, du 2022-04-01 au 2027-03-31
  • Functional analysis of the NuA4/TIP60 complex in epigenetic mechanisms linked to genome expression and stability, du 2022-10-01 au 2027-09-30
  • Functional analysis of the NuA4/TIP60 complex in epigenetic mechanisms linked to genome expression and stability, du 2022-03-01 au 2027-03-31
  • Mécanismes moléculaires orchestrant la transition épithélio-mésenchymateuse, du 2023-04-01 au 2026-03-31
  • Plateforme de culture cellulaire pour l'analyse fonctionnelle de modificateurs épigénétiques liés aux maladies humaines, du 2022-04-01 au 2023-09-28
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  • Understanding the molecular determinants of high-grade endometrial stromal sarcomas, du 2022-09-01 au 2024-08-31

Projets terminés récemment

  • Chaire de recherche du Canada en biologie de la chromatine et épigénétique moléculaire, du 2015-01-01 au 2021-12-31
  • Control of Genome Expression and Maintenance by MYST-ING Tumor Suppressor Complexes., du 2015-07-01 au 2022-06-30
  • Gene Application to engage a Model Organism Researcher – ING3, du 2021-09-01 au 2022-08-31
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