Le Dr Jacques Corbeil tire profit des plus récents progrès de la bio-informatique et de l’apprentissage machine pour aider au diagnostic, pour faciliter le pronostic et pour optimiser le traitement des maladies. La génomique génère un déluge de données qui doivent être interprétées à l’aide de nouvelles approches bio-informatiques.  Le Dr Corbeil utilise des appareils à la fine pointe de la technologie et des approches analytiques de mégadonnées, pour faciliter l’interprétation de phénotypes complexes. La recherche du Dr Corbeil porte sur l’interaction entre les microorganismes infectieux et leur hôte, l’effet des antibiotiques sur la flore microbienne, la conception de petites molécules et de médicaments pouvant interférer avec des fonctions microbiennes précises et l’intégration de données « omiques » en cancérologie. Les travaux du Dr Corbeil se situent à l’interface de l’informatique et des sciences « omiques ».

Dr Corbeil a fait ses études de premier cycle à l’Université Laval et a obtenu son doctorat à l’Université de Nouvelles-Galles du Sud, à Sydney, en Australie. Il  a ensuite rejoint l’Université de la Californie à San Diego, où il a successivement fait un stage postdoctoral, décroché un poste de professeur, puis a été promu au rang de professeur agrégé jusqu’à son retour au Canada,  où il a obtenu une chaire de recherche du Canada de niveau 1 en génomique médicale.

CHUL
2705, boulevard Laurier
R-0709
Québec, Québec
Canada G1V 4G2
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Uyar O, Plante PL, Piret J, Venable MC, Carbonneau J, Corbeil J, Boivin G

A novel bioluminescent herpes simplex virus 1 for in vivo monitoring of herpes simplex encephalitis

Article de revue

Sci Rep, 11 (1), 2021.

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Gambino AS, Déraspe M, Álvarez VE, Quiroga MP, Corbeil J, Roy PH, Centrón D

Serratia marcescens SCH909 as reservoir and source of genetic elements related to wide dissemination of antimicrobial resistance mechanisms

Article de revue

FEMS Microbiol Lett, 368 (14), 2021.

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Sirois C, Khoury R, Durand A, Deziel PL, Bukhtiyarova O, Chiu Y, Talbot D, Bureau A, Després P, Gagné C, Laviolette F, Savard AM, Corbeil J, Badard T, Jean S, Simard M

Exploring polypharmacy with artificial intelligence: data analysis protocol

Article de revue

BMC Med Inform Decis Mak, 21 (1), 2021.

Résumé | Liens:

Jungblut AD, Raymond F, Dion MB, Moineau S, Mohit V, Nguyen GQ, Déraspe M, Francovic-Fontaine É, Lovejoy C, Culley AI, Corbeil J, Vincent WF

Genomic diversity and CRISPR-Cas systems in the cyanobacterium Nostoc in the High Arctic

Article de revue

Environ Microbiol, 23 (6), 2021.

Résumé | Liens:

Dion MB, Plante PL, Zufferey E, Shah SA, Corbeil J, Moineau S

Streamlining CRISPR spacer-based bacterial host predictions to decipher the viral dark matter

Article de revue

Nucleic Acids Res, 49 (6), 2021.

Résumé | Liens:

Das PS, Gagnon-Turcotte G, Ouazaa K, Bouzid K, Hosseini SN, Bharucha E, Tremblay D, Moineau S, Messaddeq Y, Corbeil J, Gosselin B

The EcoChip 2: An Autonomous Sensor Platform for Multimodal Bio-environmental Monitoring of the Northern Habitat

Article de revue

Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc, 2020 , 2020.

Résumé | Liens:

Perkins V, Vignola S, Lessard MH, Plante PL, Corbeil J, Dugat-Bony E, Frenette M, Labrie S

Phenotypic and Genetic Characterization of the Cheese Ripening Yeast

Article de revue

Front Microbiol, 11 , 2020.

Résumé | Liens:

Lemay ML, Maaß S, Otto A, Hamel J, Plante PL, Rousseau GM, Tremblay DM, Shi R, Corbeil J, Gagne SM, Becher D, Moineau S

A Lactococcal Phage Protein Promotes Viral Propagation and Alters the Host Proteomic Response During Infection

Article de revue

Viruses, 12 (8), 2020.

Résumé | Liens:

Kothari C, Osseni MA, Agbo L, Ouellette G, Deraspe M, Laviolette F, Corbeil J, Lambert JP, Diorio C, Durocher F

Machine learning analysis identifies genes differentiating triple negative breast cancers

Article de revue

Sci Rep, 10 (1), 2020.

Résumé | Liens:

Nsio J, Kapetshi J, Makiala S, Raymond F, Tshapenda G, Boucher N, Corbeil J, Okitandjate A, Mbuyi G, Kiyele M, Mondonge V, Kikoo MJ, Van Herp M, Barboza P, Petrucci R, Benedetti G, Formenty P, Muyembe Muzinga B, Ilunga Kalenga O, Ahuka S, Fausther-Bovendo H, Ilunga BK, Kobinger GP, Muyembe JT

2017 Outbreak of Ebola Virus Disease in Northern Democratic Republic of Congo

Article de revue

J Infect Dis, 221 (5), 2020.

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Projets actifs

  • Acides biliaires et maladies inflammatoires chroniques de l’intestin : et si la solution était dans l’assiette?, du 2022-03-03 au 2023-03-02
  • Antimicrobial resistance genes in bioaerosols in Canadian arctic, rural, and urban environments: sources, profiles, transport and fate, du 2019-12-01 au 2024-11-30
  • Chaire de recherche du Canada en Medical genomics, du 2018-01-01 au 2024-12-31
  • Déterminer la qualité de la polypharmacie chez les aînés : une approche basée sur l’intelligence artificielle, du 2020-04-01 au 2023-03-31
  • Développement d'une technologie de contrôle de la qualité des plantes en cours du procédé manufacturier de médicaments en utilisant la spectrométrie de masse à haut débit couplée à des approches en apprentissage automatique , du 2020-03-19 au 2023-03-31
  • Dissecting host-microbiome modifiers of type 2 diabetes risk - Objective 1.3, du 2019-11-01 au 2024-10-31
  • Ecogenomics of mining areas for sustainable Canadian North (GENOSCAN), du 2020-11-01 au 2024-12-31
  • Extreme zooming on intestinal permeability and the western-style diet: Unravelling the role of dietary antigens on the prevalence of cardiometabolic and mental health diseases in the North, du 2020-11-01 au 2024-12-31
  • MAchine learning for diGItal diagnosTICS of antimicrobial resistance, du 2019-10-01 au 2022-09-30
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2024-03-31
  • Prédire l'évolution de l'hépatite C par la fédération de données et l'intelligence artificielle : enjeux éthiques, juridiques, sociaux et de vie privée, du 2019-04-01 au 2023-03-31
  • Unravelling the impact of diet on cardiovascular health in heterozygous familial hypercholesterolemia: a metabolomic approach, du 2021-10-01 au 2025-09-30
  • UVILUQ: l'utilisation des biopsie liquides pour le monitoring de l'état de santé des écosystèmes marins côtiers, du 2020-07-01 au 2023-06-30
  • Validation de la mesure d’expression génique unicellulaire à partir d’un échantillon de tissu hépatique chez des sujets avec une suspicion clinique de stéatose hépatique non-alcoolique., du 2022-08-24 au 2023-08-23

Projets terminés récemment

  • Advanced study of unconventional oil behaviour, innovative emergency measures to surface water oil spills: protection of water sources, du 2016-09-30 au 2020-09-29
  • Calcul Québec, du 2015-04-01 au 2022-03-31
  • Concert pour la vie, du 2020-11-13 au 2021-03-31
  • COVID19 persistent symptomatology: an investigation of the metabolomic and proteomic underpinning, du 2021-06-01 au 2022-05-31
  • Deciphering breast cancer HER2-negativity with regard to HER2-targeted therapy, du 2016-07-01 au 2021-06-30
  • La plateforme bio-environnementale EcoChip: Prototypage d'une preuve de concept robuste, du 2020-03-01 au 2021-06-01
  • Profil moléculaire sanguin de patientes souffrant de lupus, du 2019-04-01 au 2021-03-31
  • REinfection in COVid-19 Estimation of Risk (RECOVER), du 2020-06-01 au 2020-09-30
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval