Le Dr Jacques Corbeil tire profit des plus récents progrès de la bio-informatique et de l’apprentissage machine pour aider au diagnostic, pour faciliter le pronostic et pour optimiser le traitement des maladies. La génomique génère un déluge de données qui doivent être interprétées à l’aide de nouvelles approches bio-informatiques.  Le Dr Corbeil utilise des appareils à la fine pointe de la technologie et des approches analytiques de mégadonnées, pour faciliter l’interprétation de phénotypes complexes. La recherche du Dr Corbeil porte sur l’interaction entre les microorganismes infectieux et leur hôte, l’effet des antibiotiques sur la flore microbienne, la conception de petites molécules et de médicaments pouvant interférer avec des fonctions microbiennes précises et l’intégration de données « omiques » en cancérologie. Les travaux du Dr Corbeil se situent à l’interface de l’informatique et des sciences « omiques ».

Dr Corbeil a fait ses études de premier cycle à l’Université Laval et a obtenu son doctorat à l’Université de Nouvelles-Galles du Sud, à Sydney, en Australie. Il  a ensuite rejoint l’Université de la Californie à San Diego, où il a successivement fait un stage postdoctoral, décroché un poste de professeur, puis a été promu au rang de professeur agrégé jusqu’à son retour au Canada,  où il a obtenu une chaire de recherche du Canada de niveau 1 en génomique médicale.

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Kpanou R, Dallaire P, Rousseau E, Corbeil J

Learning self-supervised molecular representations for drug-drug interaction prediction

Article de revue

BMC Bioinformatics, 25 (1), 2024.

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Desjardins LC, Brière F, Tremblay AJ, Rancourt-Bouchard M, Drouin-Chartier JP, Corbeil J, Lemelin V, Charest A, Schaefer EJ, Lamarche B, Couture P

Substitution of dietary monounsaturated fatty acids from olive oil for saturated fatty acids from lard increases low-density lipoprotein apolipoprotein B-100 fractional catabolic rate in subjects with dyslipidemia associated with insulin resistance: a randomized controlled trial

Article de revue

Am J Clin Nutr, 119 (5), 2024.

Résumé | Liens:

Dzieciolowska S, Charest H, Roy T, Fafard J, Carazo S, Levade I, Longtin J, Parkes L, Beaulac SN, Villeneuve J, Savard P, Corbeil J, De Serres G, Longtin Y

Timing and Predictors of Loss of Infectivity Among Healthcare Workers With Mild Primary and Recurrent COVID-19: A Prospective Observational Cohort Study

Article de revue

Clin Infect Dis, 78 (3), 2024.

Résumé | Liens:

Zeng Y, Song Y, Cui L, Wu Q, Wang C, Coelho AC, Zhang G, Wei D, Li C, Zhang J, Corbeil J, Li Y, Feng J

Phylogenomic insights into evolutionary trajectories of multidrug resistant S. pneumoniae CC271 over a period of 14 years in China

Article de revue

Genome Med, 15 (1), 2023.

Résumé | Liens:

Brochu E, Huletsky A, Boudreau DK, Raymond F, Bérubé È, Ouameur AA, Frenette J, Boissinot M, Corbeil J, Bergeron MG

Characterization of vancomycin-resistance vanD gene clusters in the human intestinal microbiota by metagenomics and culture-enriched metagenomics

Article de revue

JAC Antimicrob Resist, 5 (2), 2023.

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Maltais-Payette I, Vijay J, Simon MM, Corbeil J, Brière F, Grundberg E, Tchernof A

Large-scale analysis of circulating glutamate and adipose gene expression in relation to abdominal obesity

Article de revue

Amino Acids, 54 (9), 2022.

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Gobeil É, Maltais-Payette I, Taba N, Brière F, Ghodsian N, Abner E, Bourgault J, Gagnon E, Manikpurage HD, Couture C, Mitchell PL, Mathieu P, Julien F, Corbeil J, Vohl MC, Thériault S, Esko T, Tchernof A, Arsenault BJ

Mendelian Randomization Analysis Identifies Blood Tyrosine Levels as a Biomarker of Non-Alcoholic Fatty Liver Disease

Article de revue

Metabolites, 12 (5), 2022.

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Déraspe M, Boisvert S, Laviolette F, Roy PH, Corbeil J

Flexible protein database based on amino acid k-mers

Article de revue

Sci Rep, 12 (1), 2022.

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Racine É, Boivin G, Longtin Y, McCormack D, Decaluwe H, Savard P, Cheng MP, Hamelin MÈ, Carbonneau J, Tadount F, Adams K, Bourdin B, Nantel S, Gilca V, Corbeil J, De Serres G, Quach-Thanh C

The REinfection in COVID-19 Estimation of Risk (RECOVER) study: Reinfection and serology dynamics in a cohort of Canadian healthcare workers

Article de revue

Influenza Other Respir Viruses, 16 (5), 2022.

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Uyar O, Dominguez JM, Bordeleau M, Lapeyre L, Ibáñez FG, Vallières L, Tremblay ME, Corbeil J, Boivin G

Single-cell transcriptomics of the ventral posterolateral nucleus-enriched thalamic regions from HSV-1-infected mice reveal a novel microglia/microglia-like transcriptional response

Article de revue

J Neuroinflammation, 19 (1), 2022.

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Projets actifs

  • Antimicrobial resistance genes in bioaerosols in Canadian arctic, rural, and urban environments: sources, profiles, transport and fate, du 2019-12-01 au 2025-11-30
  • Chaire de recherche du Canada en Medical genomics, du 2018-01-01 au 2024-12-31
  • Deciphering breast cancer HER2-negativity with regard to HER2-targeted therapy, du 2016-07-01 au 2025-03-31
  • Development of an advanced multiplexed lab-on-a-chip system for highthroughput screening using organ-on-a-chip technology to support Al drug discovery, du 2024-03-01 au 2025-02-28
  • Ecogenomics of mining areas for sustainable Canadian North (GENOSCAN), du 2020-11-01 au 2024-12-31
  • Extreme zooming on intestinal permeability and the western-style diet: Unravelling the role of dietary antigens on the prevalence of cardiometabolic and mental health diseases in the North, du 2020-11-01 au 2024-12-31
  • Identification of innate immune pathways as targets for immunomodulatory therapy in herpes simplex virus encephalitis, du 2023-10-01 au 2028-09-30
  • L'empreinte métabolomique plasmatique des produits laitiers: un reflet de leur consommation et une fenêtre sur leurs effets cardiométaboliques, du 2023-01-01 au 2025-10-01
  • National Primate Center for Pandemic Preparedness (NPCPP), du 2024-03-01 au 2028-03-31
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2025-03-31
  • PandemicStop-AI: for an accelerated response to pandemics, du 2024-03-01 au 2028-03-31
  • PandemicStop-AI: for an accelerated response to pandemics, du 2024-03-01 au 2028-03-31
  • Unravelling the impact of diet on cardiovascular health in heterozygous familial hypercholesterolemia: a metabolomic approach, du 2021-10-01 au 2025-09-30
  • Validation de la mesure d’expression génique unicellulaire à partir d’un échantillon de tissu hépatique chez des sujets avec une suspicion clinique de stéatose hépatique non-alcoolique., du 2022-08-24 au 2025-03-31

Projets terminés récemment

  • Acides biliaires et maladies inflammatoires chroniques de l’intestin : et si la solution était dans l’assiette?, du 2022-03-03 au 2023-03-02
  • Déterminer la qualité de la polypharmacie chez les aînés : une approche basée sur l’intelligence artificielle, du 2020-04-01 au 2023-03-31
  • Développement d'une technologie de contrôle de la qualité des plantes en cours du procédé manufacturier de médicaments en utilisant la spectrométrie de masse à haut débit couplée à des approches en apprentissage automatique , du 2020-03-19 au 2023-03-31
  • Développement d’algorithmes d’IA pour soutenir le développement de médicaments oncologiques, du 2024-04-01 au 2024-08-31
  • Dissecting host-microbiome modifiers of type 2 diabetes risk - Objective 1.3, du 2019-11-01 au 2024-10-31
  • Exploration multi-omique des biopsies liquides pour dépister les porteurs de bactéries pathogènes et leurs résistances, du 2023-04-24 au 2024-04-23
  • Prédire l'évolution de l'hépatite C par la fédération de données et l'intelligence artificielle : enjeux éthiques, juridiques, sociaux et de vie privée, du 2019-04-01 au 2024-03-31
  • Rôle des habitudes de vie sur le microbiote et la réponse clinique à l’immunothérapie en cancer de la vessie, du 2023-04-20 au 2024-03-31
  • UVILUQ: l'utilisation des biopsie liquides pour le monitoring de l'état de santé des écosystèmes marins côtiers, du 2020-07-01 au 2023-06-30
  • Validation des marqueurs cellulaires ChromaLive sur modèles d'organopuces, du 2022-12-12 au 2023-08-23
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval