La production de données varie entre 1 et 20 millions de lectures appariées par cycle de séquençage. Il est largement utilisé pour les analyses en métagénomique (séquençage 16S et ITS) car il permet des lectures de 300 paires de base.
| Nano | Micro | V2 | V3 | |
| Par flowcell* | ||||
| Clusters/ligne – MAX | 1 M | 4 M | 12 M | 20 M |
| 2X 50 pb | na | na | 1,2 Gb | na |
| 2X 150 pb | 0,3 Gb | 1,2 Gb | 3,6 Gb | 6,0 Gb |
| 2X 250 pb | na | na | 6,0 Gb | na |
| 2X 300 pb | na | na | na | 12 Gb |
*Le rendement peut varier selon le type de librairies.