Les bactériophages : amis et ennemis
Les bactériophages sont des virus qui infectent et détruisent les bactéries. Ils constituent les entités biologiques les plus abondantes et les plus diversifiées de la planète. Ils jouent un rôle prépondérant dans le maintien de l’équilibre des écosystèmes.

Les bactériophages peuvent être à la fois nos amis et nos ennemis. Ils sont nos amis lorsqu’ils suppriment des populations bactériennes nuisibles, incluant les bactéries pathogènes. Ces phages peuvent avoir des applications industrielles et médicales comme agents de biocontrôle. Cependant, les bactériophages deviennent nos ennemis lorsqu’ils détruisent des bactéries jouant un rôle important, en particulier dans l’industrie alimentaire.

Sylvain Moineau, titulaire de la Chaire de recherche du Canada sur les bactériophages, s’est donné comme objectif d’approfondir les connaissances sur la biologie des phages. Il privilégie une approche intégrative qui combine des données de la génomique, la protéomique et d’autres domaines pour mieux comprendre les interactions entre les phages et les bactéries.

Il cherche à mettre point de nouveaux outils pour éliminer les bactériophages dans les fermentations laitières et les utiliser comme antibactériens en santé publique et dans une grande variété de secteurs.

La recherche de Sylvain Moineau contribuera grandement à faciliter l’utilisation des bactériophages et à réduire leurs caractéristiques nuisibles.

Université Laval, Département de biochimie, de microbiologie et
2420, rue de la Terrasse, local 0657
Québec, Québec
Canada G1V 0A6
+1 418-656-2131, poste 3712
Sylvain.Moineau@bcm.ulava... sylvain.moineau@crchudequ...

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Makarova KS, Wolf YI, Iranzo J, Shmakov SA, Alkhnbashi OS, Brouns SJJ, Charpentier E, Cheng D, Haft DH, Horvath P, Moineau S, Mojica FJM, Scott D, Shah SA, Siksnys V, Terns MP, Venclovas C, White MF, Yakunin AF, Yan W, Zhang F, Garrett RA, Backofen R, van der Oost J, Barrangou R, Koonin EV

Evolutionary classification of CRISPR-Cas systems: a burst of class 2 and derived variants.

Article de revue

Nat Rev Microbiol, 18 (2), p. 67-83, 2020, ISSN: 1740-1526.

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Agudelo D, Carter S, Velimirovic M, Duringer A, Rivest JF, Levesque S, Loehr J, Mouchiroud M, Cyr D, Waters PJ, Laplante M, Moineau S, Goulet A, Doyon Y

Versatile and robust genome editing with Streptococcus thermophilus CRISPR1-Cas9.

Article de revue

Genome Res, 30 (1), p. 107-117, 2020, ISSN: 1088-9051.

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Fuchsbauer O, Swuec P, Zimberger C, Amigues B, Levesque S, Agudelo D, Duringer A, Chaves-Sanjuan A, Spinelli S, Rousseau GM, Velimirovic M, Bolognesi M, Roussel A, Cambillau C, Moineau S, Doyon Y, Goulet A

Cas9 Allosteric Inhibition by the Anti-CRISPR Protein AcrIIA6.

Article de revue

Mol Cell, 76 (6), p. 922-937.e7, 2019, ISSN: 1097-2765.

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Hutinet G, Kot W, Cui L, Hillebrand R, Balamkundu S, Gnanakalai S, Neelakandan R, Carstens AB, Fa Lui C, Tremblay D, Jacobs-Sera D, Sassanfar M, Lee YJ, Weigele P, Moineau S, Hatfull GF, Dedon PC, Hansen LH, de Crecy-Lagard V

7-Deazaguanine modifications protect phage DNA from host restriction systems.

Article de revue

Nat Commun, 10 (1), p. 5442, 2019, ISSN: 2041-1723.

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Labrie SJ, Mosterd C, Loignon S, Dupuis ME, Desjardins P, Rousseau GM, Tremblay DM, Romero DA, Horvath P, Fremaux C, Moineau S

A mutation in the methionine aminopeptidase gene provides phage resistance in Streptococcus thermophilus.

Article de revue

Sci Rep, 9 (1), p. 13816, 2019, ISSN: 2045-2322.

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Fong K, Tremblay DM, Delaquis P, Goodridge L, Levesque RC, Moineau S, Suttle CA, Wang S

Diversity and Host Specificity Revealed by Biological Characterization and Whole Genome Sequencing of Bacteriophages Infecting Salmonella enterica.

Article de revue

Viruses, 11 (9), 2019, ISSN: 1999-4915.

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Deng L, Silins R, Castro-Mejia JL, Kot W, Jessen L, Thorsen J, Shah S, Stokholm J, Bisgaard H, Moineau S, Nielsen DS

A Protocol for Extraction of Infective Viromes Suitable for Metagenomics Sequencing from Low Volume Fecal Samples.

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Viruses, 11 (7), 2019, ISSN: 1999-4915.

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Chabas H, Nicot A, Meaden S, Westra ER, Tremblay DM, Pradier L, Lion S, Moineau S, Gandon S

Variability in the durability of CRISPR-Cas immunity.

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Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci, 374 (1772), p. 20180097, 2019, ISSN: 0962-8436.

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da Silva Xavier A, de Almeida JCF, de Melo AG, Rousseau GM, Tremblay DM, de Rezende RR, Moineau S, Alfenas-Zerbini P

Characterization of CRISPR-Cas systems in the Ralstonia solanacearum species complex.

Article de revue

Mol Plant Pathol, 20 (2), p. 223-239, 2019, ISSN: 1464-6722.

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Lemay ML, Otto A, Maass S, Plate K, Becher D, Moineau S

Investigating Lactococcus lactis MG1363 Response to Phage p2 Infection at the Proteome Level.

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Mol Cell Proteomics, 18 (4), p. 704-714, 2019, ISSN: 1535-9476.

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Projets actifs

  • 3.2 Comprehensive environmental monitoring and valorisation: From molecules to microorganisms, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada, du 2016-04-01 au 2020-03-31
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  • Bacteriophages and plasmids in Streptococcus thermophilus, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), du 2019-04-01 au 2024-03-31
  • Bio-sourced reagents for the flotation of minerals in the mining industry, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de recherche et développement coopérative (RDC), du 2019-02-01 au 2022-01-31
  • Centre de recherche du CHU de Québec - Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
  • Chaire de recherche du Canada sur les bactériophages, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement, du 2018-11-01 au 2025-10-31
  • Congrès CRISPR - 17 au 20 juin 2019, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Contributions, du 2019-03-27 au 2020-04-30
  • Groupe de recherche en écologie buccale, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2014-05-01 au 2020-04-30
  • New letters to the DNA alphabet, Subvention, International Human Frontier Science Program Organization, du 2018-08-01 au 2021-07-31
  • Op+LAIT : Regroupement de recherche pour un lait de qualité optimale (Op+Lait), Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2017-04-01 au 2023-03-31
  • PhageGUT - Phages for target specific manipulation of the gut microbiota, Subvention, Danish Agency for Science, Technology and Innovation, du 2016-01-11 au 2020-04-30
  • Phages as a One Health approach for the replacement of antibiotics, and reduction of drug resistant nontyphoidal Salmonella, in poultry frams in Kenya, Subvention, Centre de recherches pour le développement international, Appel de propositions : Élaborer des solutions vétérinaires innovatrices pour la résistance aux antimicrobiens, du 2019-03-01 au 2021-12-01
  • Prix John-C.-Polanyi, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Prix John-C.-Polanyi, du 2017-04-01 au 2022-03-31
  • PROTEO, le regroupement québécois de recherche sur la fonction, l'ingénierie et les applications des protéines (PROTEO), Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2015-04-01 au 2021-03-31
  • Regroupement québécois de recherche sur la fonction, la structure et l'ingénierie des protéines, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2014-05-01 au 2020-04-30
  • Volet in vivo de la mise au point de cocktails de bactériophages ciblant Aeromonas salmonicida, l'agent étiologique de la furonculose, Subvention, Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation, INNOVAMER, du 2019-04-01 au 2022-03-31

Projets terminés récemment

  • A syst-Omics approach to ensuring food safety and reducing the economic burden of salmonellosis, Subvention, Génome Canada, La génomique pour nourrir l'avenir, du 2015-04-01 au 2019-03-31
  • Bacteriophages and plasmids in Streptococcus thermophilus, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), du 2014-04-01 au 2019-03-31
  • Canadian Microbiome Resource (CanMoR) - Avis d'intention, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Autre : Initiative canadienne microbiome 2 : Plateforme de recherche, du 2018-05-01 au 2019-03-31
  • Chaire de recherche du Canada sur les bactériophages, Subvention, Secrétariat des Chaires de recherche du Canada, Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement, du 2011-11-01 au 2018-10-31
  • Control of Phages during the manufacture of cheeses with surface ripening Brevibacterium, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de recherche et développement coopérative (RDC), du 2015-05-01 au 2019-04-30
  • Controlling phages in large-scale cheese produciton, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Prix synergie pour l'innovation, du 2013-10-09 au 2018-10-08
  • Influence of diet on early life gut virome - a key player in shaping the gut microbiota, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention d'équipe: Microbiomique, du 2016-01-01 au 2018-12-31
  • Mise au point de cocktails de bacteriophages ciblant aeromonas salmonicida, l'agent etiologique de la furonculose, Subvention, Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation, INNOVAMER, du 2014-01-26 au 2018-12-31
  • Soutien à la Collection Félix D'Hérelle, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Cas spéciaux et obligations institutionnelles, du 2018-07-09 au 2019-04-30
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval