Le Dr Samer Hussein est chercheur au Centre de Recherche du CHU de Québec – Université Laval, dans le groupe St-Patrick de recherche en oncologie fondamentale. Il est également professeur adjoint au département de biologie moléculaire, biochimie médicale et pathologie de la Faculté de médecine, Université Laval.

Ses travaux de recherche visent à comprendre les mécanismes moléculaires qui établissent et régulent les états cellulaires pluripotents, particulièrement le rôle des ARN longs non-codants dans les réseaux géniques, ainsi que les événements transcriptionnels responsables de l’initiation et de la progression du cancer.

Définir les réseaux de gènes et leurs interactions contrôlant les états pluripotents
La pluripotence se définit comme la faculté d’une cellule à générer tous les types cellulaires d’un organisme. Les trois facteurs de transcription Oct4, Sox2, et Nanog représentent les piliers centraux du réseau de régulation des gènes associé au maintien d’un état pluripotent. Grâce à des modèles cellulaires de pluripotence et de reprogrammation ainsi qu’à l’utilisation de technologies à haut débit (protéomique, RNA-seq et ChIP-seq), ce projet a pour but de comprendre comment les interactions entre les facteurs de transcription de pluripotence et les régulateurs de la chromatine déterminent le destin cellulaire et la transition des cellules vers des lignées spécifiques dans le développement embryonnaire ainsi que celui du cancer.

Définir le rôle de certains ARN longs non-codants dans l’identité cellulaire
Les ARN longs non-codants (lncRNA) constituent une classe à part entière d’ARN, caractérisés par le fait qu’ils ne codent pour aucune protéine connue et qu’ils sont composés d’au moins 200 paires de bases. Les lncRNA ont été impliqués dans la régulation génique et le maintien de l’identité cellulaire, mais leur mécanisme d’action impliqué dans l’établissement de la pluripotence demeure inconnu. L’objectif de ce projet est de comprendre le rôle des lncRNAs dans la régulation des états pluripotents et la reprogrammation des cellules souches embryonnaires.

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Benevento M, Tonge PD, Puri MC, Hussein SM, Cloonan N, Wood DL, Grimmond SM, Nagy A, Munoz J, Heck AJ

Proteome adaptation in cell reprogramming proceeds via distinct transcriptional networks.

Article de revue

Nat Commun, 5 , 2014.

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Michael IP, Westenskow PD, Hacibekiroglu S, Greenwald AC, Ballios BG, Kurihara T, Li Z, Warren CM, Zhang P, Aguilar E, Donaldson L, Marchetti V, Baba T, Hussein SM, Sung HK, Iruela-Arispe ML, Rini JM, van der Kooy D, Friedlander M, Nagy A

Local acting Sticky-trap inhibits vascular endothelial growth factor dependent pathological angiogenesis in the eye.

Article de revue

EMBO Mol Med, 6 (5), 2014.

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Laurila K, Autio R, Kong L, Narva E, Hussein S, Otonkoski T, Lahesmaa R, Lahdesmaki H

Integrative genomics and transcriptomics analysis of human embryonic and induced pluripotent stem cells.

Article de revue

BioData Min, 7 (1), 2014.

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Tonge PD, Corso AJ, Monetti C, Hussein SM, Puri MC, Michael IP, Li M, Lee DS, Mar JC, Cloonan N, Wood DL, Gauthier ME, Korn O, Clancy JL, Preiss T, Grimmond SM, Shin JY, Seo JS, Wells CA, Rogers IM, Nagy A

Divergent reprogramming routes lead to alternative stem-cell states.

Article de revue

Nature, 516 (7530), 2014.

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Hussein SM, Puri MC, Tonge PD, Benevento M, Corso AJ, Clancy JL, Mosbergen R, Li M, Lee DS, Cloonan N, Wood DL, Munoz J, Middleton R, Korn O, Patel HR, White CA, Shin JY, Gauthier ME, Le Cao KA, Kim JI, Mar JC, Shakiba N, Ritchie W, Rasko JE, Grimmond SM, Zandstra PW, Wells CA, Preiss T, Seo JS, Heck AJ, Rogers IM, Nagy A

Genome-wide characterization of the routes to pluripotency.

Article de revue

Nature, 516 (7530), 2014.

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Carlsson E, Krohn K, Ovaska K, Lindberg P, Hayry V, Maliniemi P, Lintulahti A, Korja M, Kivisaari R, Hussein S, Sarna S, Niiranen K, Hautaniemi S, Haapasalo H, Ranki A

Neuron navigator 3 alterations in nervous system tumors associate with tumor malignancy grade and prognosis.

Article de revue

Genes Chromosomes Cancer, 52 (2), 2013.

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Hussein SM, Elbaz J, Nagy AA

Genome damage in induced pluripotent stem cells: assessing the mechanisms and their consequences.

Article de revue

Bioessays, 35 (3), 2013.

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Bisson N, Ruston J, Jeansson M, Vanderlaan R, Hardy WR, Du J, Hussein SM, Coward RJ, Quaggin SE, Pawson T

The adaptor protein Grb2 is not essential for the establishment of the glomerular filtration barrier.

Article de revue

PLoS One, 7 (11), 2012.

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Ji J, Ng SH, Sharma V, Neculai D, Hussein S, Sam M, Trinh Q, Church GM, McPherson JD, Nagy A, Batada NN

Elevated coding mutation rate during the reprogramming of human somatic cells into induced pluripotent stem cells.

Article de revue

Stem Cells, 30 (3), 2012.

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Hussein SM, Nagy AA

Progress made in the reprogramming field: new factors, new strategies and a new outlook.

Article de revue

Curr Opin Genet Dev, 22 (5), 2012.

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Projets actifs

  • Étude de criblage sur la reprogrammation du métabolisme, du micro-environnement tumoral et des cellules souches cancéreuses dans le médulloblastome, du 2021-05-01 au 2022-04-30
  • The role of long non-coding RNAs in defining pluripotent stem cell states, du 2017-04-01 au 2022-03-31
  • Transcription factor stoichiometry defines distinct pluripotent states, du 2016-04-01 au 2022-03-31

Projets terminés récemment

  • Connecting the pluripotency gene network to development and disease, du 2017-08-01 au 2019-12-31
  • Efficient and reliable shearing of chromatin for highthroughput analysis, du 2019-03-28 au 2020-03-31
  • Les réseaux d’interactions moléculaires dans les états de pluripotence différents, du 2017-07-01 au 2020-06-30
  • Les réseaux d’interactions moléculaires dans les états de pluripotence différents, du 2017-07-01 au 2021-06-30
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