Le Dr Samer Hussein est chercheur au Centre de Recherche du CHU de Québec – Université Laval, dans le groupe St-Patrick de recherche en oncologie fondamentale. Il est également professeur adjoint au département de biologie moléculaire, biochimie médicale et pathologie de la Faculté de médecine, Université Laval.

Ses travaux de recherche visent à comprendre les mécanismes moléculaires qui établissent et régulent les états cellulaires pluripotents, particulièrement le rôle des ARN longs non-codants dans les réseaux géniques, ainsi que les événements transcriptionnels responsables de l’initiation et de la progression du cancer.

Définir les réseaux de gènes et leurs interactions contrôlant les états pluripotents
La pluripotence se définit comme la faculté d’une cellule à générer tous les types cellulaires d’un organisme. Les trois facteurs de transcription Oct4, Sox2, et Nanog représentent les piliers centraux du réseau de régulation des gènes associé au maintien d’un état pluripotent. Grâce à des modèles cellulaires de pluripotence et de reprogrammation ainsi qu’à l’utilisation de technologies à haut débit (protéomique, RNA-seq et ChIP-seq), ce projet a pour but de comprendre comment les interactions entre les facteurs de transcription de pluripotence et les régulateurs de la chromatine déterminent le destin cellulaire et la transition des cellules vers des lignées spécifiques dans le développement embryonnaire ainsi que celui du cancer.

Définir le rôle de certains ARN longs non-codants dans l’identité cellulaire
Les ARN longs non-codants (lncRNA) constituent une classe à part entière d’ARN, caractérisés par le fait qu’ils ne codent pour aucune protéine connue et qu’ils sont composés d’au moins 200 paires de bases. Les lncRNA ont été impliqués dans la régulation génique et le maintien de l’identité cellulaire, mais leur mécanisme d’action impliqué dans l’établissement de la pluripotence demeure inconnu. L’objectif de ce projet est de comprendre le rôle des lncRNAs dans la régulation des états pluripotents et la reprogrammation des cellules souches embryonnaires.

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Fort V, Khelifi G, Hussein SMI

Long non-coding RNAs and transposable elements: A functional relationship.

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Biochim Biophys Acta Mol Cell Res, 1868 (1), 2021.

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Khelifi G, Hussein SMI

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Front Cell Dev Biol, 8 , 2020.

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Subramania S, Gagne LM, Campagne S, Fort V, O'Sullivan J, Mocaer K, Feldmuller M, Masson JY, Allain FHT, Hussein SM, Huot ME

SAM68 interaction with U1A modulates U1 snRNP recruitment and regulates mTor pre-mRNA splicing.

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Nucleic Acids Res, 47 (8), 2019.

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Kim KH, Kim YH, Son JE, Lee JH, Kim S, Choe MS, Moon JH, Zhong J, Fu K, Lenglin F, Yoo JA, Bilan PJ, Klip A, Nagy A, Kim JR, Park JG, Hussein SM, Doh KO, Hui CC, Sung HK

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Irx3 is required for postnatal maturation of the mouse ventricular conduction system.

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Sci Rep, 6 , 2016.

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Shakiba N, White CA, Lipsitz YY, Yachie-Kinoshita A, Tonge PD, Hussein SM, Puri MC, Elbaz J, Morrissey-Scoot J, Li M, Munoz J, Benevento M, Rogers IM, Hanna JH, Heck AJ, Wollscheid B, Nagy A, Zandstra PW

CD24 tracks divergent pluripotent states in mouse and human cells.

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Hussein SM, Puri MC, Tonge PD, Benevento M, Corso AJ, Clancy JL, Mosbergen R, Li M, Lee DS, Cloonan N, Wood DL, Munoz J, Middleton R, Korn O, Patel HR, White CA, Shin JY, Gauthier ME, Cao KA, Kim JI, Mar JC, Shakiba N, Ritchie W, Rasko JE, Grimmond SM, Zandstra PW, Wells CA, Preiss T, Seo JS, Heck AJ, Rogers IM, Nagy A

Corrigendum: Genome-wide characterization of the routes to pluripotency.

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Corrigendum: Divergent reprogramming routes lead to alternative stem-cell states.

Article de revue

Nature, 523 (7562), 2015.

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Lee DS, Shin JY, Tonge PD, Puri MC, Lee S, Park H, Lee WC, Hussein SM, Bleazard T, Yun JY, Kim J, Li M, Cloonan N, Wood D, Clancy JL, Mosbergen R, Yi JH, Yang KS, Kim H, Rhee H, Wells CA, Preiss T, Grimmond SM, Rogers IM, Nagy A, Seo JS

An epigenomic roadmap to induced pluripotency reveals DNA methylation as a reprogramming modulator.

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Small RNA changes en route to distinct cellular states of induced pluripotency.

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Nat Commun, 5 , 2014.

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Projets actifs

  • Étude de criblage sur la reprogrammation du métabolisme, du micro-environnement tumoral et des cellules souches cancéreuses dans le médulloblastome, du 2021-05-01 au 2022-04-30
  • The role of long non-coding RNAs in defining pluripotent stem cell states, du 2017-04-01 au 2022-03-31
  • Transcription factor stoichiometry defines distinct pluripotent states, du 2016-04-01 au 2022-03-31

Projets terminés récemment

  • Connecting the pluripotency gene network to development and disease, du 2017-08-01 au 2019-12-31
  • Efficient and reliable shearing of chromatin for highthroughput analysis, du 2019-03-28 au 2020-03-31
  • Les réseaux d’interactions moléculaires dans les états de pluripotence différents, du 2017-07-01 au 2020-06-30
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