Le Dr Jacques Corbeil tire profit des plus récents progrès de la bio-informatique et de l’apprentissage machine pour aider au diagnostic, pour faciliter le pronostic et pour optimiser le traitement des maladies. La génomique génère un déluge de données qui doivent être interprétées à l’aide de nouvelles approches bio-informatiques.  Le Dr Corbeil utilise des appareils à la fine pointe de la technologie et des approches analytiques de mégadonnées, pour faciliter l’interprétation de phénotypes complexes. La recherche du Dr Corbeil porte sur l’interaction entre les microorganismes infectieux et leur hôte, l’effet des antibiotiques sur la flore microbienne, la conception de petites molécules et de médicaments pouvant interférer avec des fonctions microbiennes précises et l’intégration de données « omiques » en cancérologie. Les travaux du Dr Corbeil se situent à l’interface de l’informatique et des sciences « omiques ».

Dr Corbeil a fait ses études de premier cycle à l’Université Laval et a obtenu son doctorat à l’Université de Nouvelles-Galles du Sud, à Sydney, en Australie. Il  a ensuite rejoint l’Université de la Californie à San Diego, où il a successivement fait un stage postdoctoral, décroché un poste de professeur, puis a été promu au rang de professeur agrégé jusqu’à son retour au Canada,  où il a obtenu une chaire de recherche du Canada de niveau 1 en génomique médicale.

CHUL
2705, boulevard Laurier
RC-709
Québec, Québec
Canada G1V 4G2
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Maheux AF, Boudreau DK, Berube E, Boissinot M, Raymond F, Brodeur S, Corbeil J, Isabel S, Omar RF, Bergeron MG

Draft Genome Sequence of a Sporulating and Motile Strain of Lachnotalea glycerini Isolated from Water in Québec City, Canada.

Article de revue

Genome Announc, 5 (42), 2017.

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Maheux AF, Boudreau DK, Berube E, Boissinot M, Raymond F, Brodeur S, Corbeil J, Brightwell G, Broda D, Omar RF, Bergeron MG

Draft Genome Sequence of Romboutsia maritimum sp. nov. Strain CCRI-22766T, Isolated from Coastal Estuarine Mud.

Article de revue

Genome Announc, 5 (41), 2017.

Résumé | Liens:

Maheux AF, Boudreau DK, Berube E, Boissinot M, Cantin P, Raymond F, Corbeil J, Omar RF, Bergeron MG

Draft Genome Sequence of Romboutsia weinsteinii sp. nov. Strain CCRI-19649T Isolated from Surface Water.

Article de revue

Genome Announc, 5 (40), 2017.

Résumé | Liens:

Deraspe M, Raymond F, Boisvert S, Culley A, Roy PH, Laviolette F, Corbeil J

Phenetic Comparison of Prokaryotic Genomes Using k-mers.

Article de revue

Mol Biol Evol, 34 (10), p. 2716-2729, 2017, ISSN: 0737-4038.

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Deshiere A, Joly-Beauparlant C, Breton Y, Ouellet M, Raymond F, Lodge R, Barat C, Roy MA, Corbeil J, Tremblay MJ

Global Mapping of the Macrophage-HIV-1 Transcriptome Reveals that Productive Infection Induces Remodeling of Host Cell DNA and Chromatin.

Article de revue

Sci Rep, 7 (1), p. 5238, 2017, ISSN: 2045-2322.

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Pavey SA, Laporte M, Normandeau E, Gaudin J, Letourneau L, Boisvert S, Corbeil J, Audet C, Bernatchez L

Draft genome of the American Eel (Anguilla rostrata).

Article de revue

Mol Ecol Resour, 17 (4), p. 806-811, 2017, ISSN: 1755-098X.

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Chaillot J, Cook MA, Corbeil J, Sellam A

Genome-Wide Screen for Haploinsufficient Cell Size Genes in the Opportunistic Yeast Candida albicans.

Article de revue

G3 (Bethesda), 7 (2), p. 355-360, 2017, ISSN: 2160-1836.

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Drouin A, Giguere S, Deraspe M, Marchand M, Tyers M, Loo VG, Bourgault AM, Laviolette F, Corbeil J

Predictive computational phenotyping and biomarker discovery using reference-free genome comparisons.

Article de revue

BMC Genomics, 17 (1), p. 754, 2016.

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Raymond F, Deraspe M, Boissinot M, Bergeron MG, Corbeil J

Partial recovery of microbiomes after antibiotic treatment.

Article de revue

Gut Microbes, 7 (5), p. 428-34, 2016, ISSN: 1949-0976.

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Maheux AF, Berube E, Boudreau DK, Raymond F, Corbeil J, Roy PH, Boissinot M, Omar RF

Draft Genome Sequence of Criibacterium bergeronii gen. nov., sp. nov., Strain CCRI-22567T, Isolated from a Vaginal Sample from a Woman with Bacterial Vaginosis.

Article de revue

Genome Announc, 4 (5), 2016.

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Projets actifs

  • 3.2 Comprehensive environmental monitoring and valorisation: From molecules to microorganisms, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada, du 2016-04-01 au 2020-03-31
  • Advanced study of unconventional oil behaviour, innovative emergency measures to surface water oil spills: protection of water sources, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de projets stratégiques (SPS), du 2016-09-30 au 2020-09-29
  • Calcul Québec, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2015-04-01 au 2021-03-31
  • Canada Research Chair in Medical genomics, Partenariat, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Fonds des leaders John-R.-Evans - CRC (anciennement : Chaires de recherche du Canada - infrastructure et Fonds des leaders - Volet 2), du 2018-08-01 au 2019-12-31
  • Centre de recherche du CHU de Québec - Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
  • Centre de recherche en arthrite de l'Université Laval, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Entités de recherche en émergence, du 2019-01-01 au 2020-01-31
  • Centre de recherche en données massives, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2016-06-07 au 2021-06-06
  • Centre de recherche en infectiologie, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 1996-06-01 au 2020-04-30
  • Chaire de recherche du Canada en Medical genomics, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement, du 2018-01-01 au 2024-12-31
  • Deciphering breast cancer HER2-negativity with regard to HER2-targeted therapy, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Volet Projet: Concours pilotes, du 2016-07-01 au 2020-06-30
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Société et culture, Appel à propositions : création d’un Observatoire international sur les impacts sociétaux de l’intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2024-03-31
  • Prédire l'évolution de l'hépatite C par la fédération de données et l'intelligence artificielle : enjeux éthiques, juridiques, sociaux et de vie privée, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention Projet, du 2019-04-01 au 2022-03-31

Projets terminés récemment

  • Canadian Microbiome Resource (CanMoR) - Avis d'intention, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Autre : Initiative canadienne microbiome 2 : Plateforme de recherche, du 2018-05-01 au 2019-03-31
  • Evaluation of blood products in health and disease using machine learning and high throughput mass spectrometry, Subvention, MITACS Inc., Converge Project Proposal, du 2016-03-01 au 2019-03-31
  • Infrastructure to Curb Atherosclerosis Through Precision Medicine, Partenariat, Fondation Canadienne pour l'innovation (La), Fonds d'innovation (FI), du 2018-08-15 au 2019-03-31
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval