Le Dr Jacques Corbeil tire profit des plus récents progrès de la bio-informatique et de l’apprentissage machine pour aider au diagnostic, pour faciliter le pronostic et pour optimiser le traitement des maladies. La génomique génère un déluge de données qui doivent être interprétées à l’aide de nouvelles approches bio-informatiques. Le Dr Corbeil utilise des appareils à la fine pointe de la technologie et des approches analytiques de mégadonnées, pour faciliter l’interprétation de phénotypes complexes. La recherche du Dr Corbeil porte sur l’interaction entre les microorganismes infectieux et leur hôte, l’effet des antibiotiques sur la flore microbienne, la conception de petites molécules et de médicaments pouvant interférer avec des fonctions microbiennes précises et l’intégration de données « omiques » en cancérologie. Les travaux du Dr Corbeil se situent à l’interface de l’informatique et des sciences « omiques ».
Dr Corbeil a fait ses études de premier cycle à l’Université Laval et a obtenu son doctorat à l’Université de Nouvelles-Galles du Sud, à Sydney, en Australie. Il a ensuite rejoint l’Université de la Californie à San Diego, où il a successivement fait un stage postdoctoral, décroché un poste de professeur, puis a été promu au rang de professeur agrégé jusqu’à son retour au Canada, où il a obtenu une chaire de recherche du Canada de niveau 1 en génomique médicale.
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- Brière, FrancisÉtudiant 2e cyclefrancis.briere.1@ulaval.cafrancis.briere@crchudequebec.ulaval.ca
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A Lactococcal Phage Protein Promotes Viral Propagation and Alters the Host Proteomic Response During Infection.
Article de revueViruses, 12 (8), 2020, ISSN: 1999-4915.
Machine learning analysis identifies genes differentiating triple negative breast cancers.
Article de revueSci Rep, 10 (1), p. 10464, 2020, ISSN: 2045-2322.
2017 Outbreak of Ebola Virus Disease in Northern Democratic Republic of Congo.
Article de revueJ Infect Dis, 221 (5), p. 701-706, 2020, ISSN: 0022-1899.
Phenotypic and Genetic Characterization of the Cheese Ripening Yeast Geotrichum candidum.
Article de revueFront Microbiol, 11 , p. 737, 2020, ISSN: 1664-302X.
Mass spectra alignment using virtual lock-masses.
Article de revueSci Rep, 9 (1), p. 8469, 2019, ISSN: 2045-2322.
Predicting Ion Mobility Collision Cross-Sections Using a Deep Neural Network: DeepCCS.
Article de revueAnal Chem, 91 (8), p. 5191-5199, 2019, ISSN: 0003-2700.
Culture-enriched human gut microbiomes reveal core and accessory resistance genes.
Article de revueMicrobiome, 7 (1), p. 56, 2019, ISSN: 2049-2618.
Interpretable genotype-to-phenotype classifiers with performance guarantees.
Article de revueSci Rep, 9 (1), p. 4071, 2019, ISSN: 2045-2322.
Clostridium difficile: Investigating Transmission Patterns Between Infected and Colonized Patients Using Whole Genome Sequencing.
Article de revueClin Infect Dis, 68 (2), p. 204-209, 2019, ISSN: 1058-4838.
Complete Genome Sequence of Escherichia coli Siphophage BRET.
Article de revueMicrobiol Resour Announc, 8 (5), 2019, ISSN: 2576-098X.
Projets actifs
- Antimicrobial resistance genes in bioaerosols in Canadian arctic, rural, and urban environments: sources, profiles, transport and fate, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Frontières de la découverte : Résistance aux antimicrobiens dans l'environnement, du 2019-12-01 au 2023-11-30
- Calcul Québec, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2015-04-01 au 2021-03-31
- Centre de recherche du CHU de Québec - Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
- Centre de recherche en données massives, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2016-06-07 au 2021-06-06
- Centre de recherche en infectiologie, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 1996-06-01 au 2024-11-06
- Chaire de recherche du Canada en Medical genomics, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement, du 2018-01-01 au 2024-12-31
- Deciphering breast cancer HER2-negativity with regard to HER2-targeted therapy, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Volet Projet: Concours pilotes, du 2016-07-01 au 2021-03-31
- Déterminer la qualité de la polypharmacie chez les aînés : une approche basée sur l’intelligence artificielle, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention de fonctionnement : Projets de recherche concertée sur la santé (avec le CRSNG), du 2020-04-01 au 2023-03-31
- Développement d'une technologie de contrôle de la qualité des plantes en cours du procédé manufacturier de médicaments en utilisant la spectrométrie de masse à haut débit couplée à des approches en apprentissage automatique , Subvention, Consortium québécois sur la découverte du médicament, Concours FOCUS, du 2020-03-19 au 2023-03-31
- La plateforme bio-environnementale EcoChip: Prototypage d'une preuve de concept robuste, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Sentinelle Nord - Fonds de maturation, du 2020-03-01 au 2021-06-01
- MAchine learning for diGItal diagnosTICS of antimicrobial resistance, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance JPIAMR, du 2019-10-01 au 2022-09-30
- Nutrition, santé et société (NUTRISS), Subvention, Fonds de recherche du Québec - Santé, Nouveaux Centres et Instituts de recherche - Subventions régulières, du 2019-04-01 au 2024-03-31
- Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Société et culture, Appel à propositions : création d’un Observatoire international sur les impacts sociétaux de l’intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2024-03-31
- Prédire l'évolution de l'hépatite C par la fédération de données et l'intelligence artificielle : enjeux éthiques, juridiques, sociaux et de vie privée, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention Projet, du 2019-04-01 au 2022-03-31
Projets terminés récemment
- 3.2 Comprehensive environmental monitoring and valorisation: From molecules to microorganisms, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada, du 2016-04-01 au 2020-03-31
- Advanced study of unconventional oil behaviour, innovative emergency measures to surface water oil spills: protection of water sources, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de projets stratégiques (SPS), du 2016-09-30 au 2020-09-29
- Canada Research Chair in Medical genomics, Partenariat, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Fonds des leaders John-R.-Evans - CRC (anciennement : Chaires de recherche du Canada - infrastructure et Fonds des leaders - Volet 2), du 2018-08-01 au 2019-12-31
- Centre de recherche en arthrite de l'Université Laval, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Entités de recherche en émergence, du 2019-01-01 au 2020-01-31
- Chantier thématique 3: Microbiosmes: Sentinelles de l'environnement et de la santé dans le Nord / 3.0 Budget de coordination du Chantier thématique 3, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada, du 2016-04-01 au 2020-03-31