Le Dr Jacques Corbeil tire profit des plus récents progrès de la bio-informatique et de l’apprentissage machine pour aider au diagnostic, pour faciliter le pronostic et pour optimiser le traitement des maladies. La génomique génère un déluge de données qui doivent être interprétées à l’aide de nouvelles approches bio-informatiques.  Le Dr Corbeil utilise des appareils à la fine pointe de la technologie et des approches analytiques de mégadonnées, pour faciliter l’interprétation de phénotypes complexes. La recherche du Dr Corbeil porte sur l’interaction entre les microorganismes infectieux et leur hôte, l’effet des antibiotiques sur la flore microbienne, la conception de petites molécules et de médicaments pouvant interférer avec des fonctions microbiennes précises et l’intégration de données « omiques » en cancérologie. Les travaux du Dr Corbeil se situent à l’interface de l’informatique et des sciences « omiques ».

Dr Corbeil a fait ses études de premier cycle à l’Université Laval et a obtenu son doctorat à l’Université de Nouvelles-Galles du Sud, à Sydney, en Australie. Il  a ensuite rejoint l’Université de la Californie à San Diego, où il a successivement fait un stage postdoctoral, décroché un poste de professeur, puis a été promu au rang de professeur agrégé jusqu’à son retour au Canada,  où il a obtenu une chaire de recherche du Canada de niveau 1 en génomique médicale.

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Plante PL, Francovic-Fontaine E, May JC, McLean JA, Baker ES, Laviolette F, Marchand M, Corbeil J

Predicting Ion Mobility Collision Cross-Sections Using a Deep Neural Network: DeepCCS.

Article de revue

Anal Chem, 91 (8), p. 5191-5199, 2019, ISSN: 0003-2700.

Résumé | Liens:

Raymond F, Boissinot M, Ouameur AA, Deraspe M, Plante PL, Kpanou SR, Berube E, Huletsky A, Roy PH, Ouellette M, Bergeron MG, Corbeil J

Culture-enriched human gut microbiomes reveal core and accessory resistance genes.

Article de revue

Microbiome, 7 (1), p. 56, 2019, ISSN: 2049-2618.

Résumé | Liens:

Nsio J, Kapetshi J, Makiala S, Raymond F, Tshapenda G, Boucher N, Corbeil J, Okitandjate A, Mbuyi G, Kiyele M, Mondonge V, Kikoo MJ, Van Herp M, Barboza P, Petrucci R, Benedetti G, Formenty P, Muyembe Muzinga B, Ilunga Kalenga O, Ahuka S, Fausther-Bovendo H, Ilunga BK, Kobinger GP, Muyembe JT

2017 Outbreak of Ebola Virus Disease in Northern Democratic Republic of Congo.

Article de revue

J Infect Dis, 2019, ISSN: 0022-1899.

Résumé | Liens:

Drouin A, Letarte G, Raymond F, Marchand M, Corbeil J, Laviolette F

Interpretable genotype-to-phenotype classifiers with performance guarantees.

Article de revue

Sci Rep, 9 (1), p. 4071, 2019, ISSN: 2045-2322.

Résumé | Liens:

Kong LY, Eyre DW, Corbeil J, Raymond F, Walker AS, Wilcox MH, Crook DW, Michaud S, Toye B, Frost E, Dendukuri N, Schiller I, Bourgault AM, Dascal A, Oughton M, Longtin Y, Poirier L, Brassard P, Turgeon N, Gilca R, Loo VG

Clostridium difficile: Investigating Transmission Patterns Between Infected and Colonized Patients Using Whole Genome Sequencing.

Article de revue

Clin Infect Dis, 68 (2), p. 204-209, 2019, ISSN: 1058-4838.

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Ngazoa-Kakou S, Shao Y, Rousseau GM, Addablah AA, Tremblay DM, Hutinet G, Lemire N, Plante PL, Corbeil J, Koudou A, Soro BK, Coulibaly DN, Aoussi S, Dosso M, Moineau S

Complete Genome Sequence of Escherichia coli Siphophage BRET.

Article de revue

Microbiol Resour Announc, 8 (5), 2019, ISSN: 2576-098X.

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Labbe M, Raymond F, Levesque A, Thaler M, Mohit V, Audet M, Corbeil J, Culley A

Communities of Phytoplankton Viruses across the Transition Zone of the St. Lawrence Estuary.

Article de revue

Viruses, 10 (12), 2018, ISSN: 1999-4915.

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Brisebois E, Veillette M, Dion-Dupont V, Lavoie J, Corbeil J, Culley A, Duchaine C

Human viral pathogens are pervasive in wastewater treatment center aerosols.

Article de revue

J Environ Sci (China), 67 , p. 45-53, 2018, ISSN: 1001-0742.

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Sylvain M, Lehoux F, Morency S, Faucher F, Bharucha E, Tremblay DM, Raymond F, Sarrazin D, Allard M, Moineau S, Corbeil J, Messaddeq Y, Gosselin B

The EcoChip: A Wireless Multi-Sensor Platform for Comprehensive Environmental Monitoring.

Article de revue

IEEE Trans Biomed Circuits Syst, 12 (6), p. 1289-1300, 2018, ISSN: 1932-4545.

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Maheux AF, Boudreau DK, Berube E, Boissinot M, Raymond F, Brodeur S, Corbeil J, Isabel S, Omar RF, Bergeron MG

Draft Genome Sequence of a Sporulating and Motile Strain of Lachnotalea glycerini Isolated from Water in Québec City, Canada.

Article de revue

Genome Announc, 5 (42), 2017.

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Projets actifs

  • 3.2 Comprehensive environmental monitoring and valorisation: From molecules to microorganisms, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada, du 2016-04-01 au 2020-03-31
  • Advanced study of unconventional oil behaviour, innovative emergency measures to surface water oil spills: protection of water sources, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de projets stratégiques (SPS), du 2016-09-30 au 2019-09-29
  • Calcul Québec, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2015-04-01 au 2021-03-31
  • Canada Research Chair in Medical genomics, Partenariat, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Fonds des leaders John-R.-Evans - CRC (anciennement : Chaires de recherche du Canada - infrastructure et Fonds des leaders - Volet 2), du 2018-08-01 au 2019-12-31
  • Centre de recherche en arthrite de l'Université Laval, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Entités de recherche en émergence, du 2019-01-01 au 2020-01-31
  • Centre de recherche en données massives, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2016-06-07 au 2021-06-06
  • Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
  • Chaire de recherche du Canada en Medical genomics, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement, du 2018-01-01 au 2024-12-31
  • Deciphering breast cancer HER2-negativity with regard to HER2-targeted therapy, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Volet Projet: Concours pilotes, du 2016-07-01 au 2020-06-30
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Société et culture, Appel à propositions : création d’un Observatoire international sur les impacts sociétaux de l’intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2024-03-31

Projets terminés récemment

  • Canadian Microbiome Resource (CanMoR) - Avis d'intention, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Autre : Initiative canadienne microbiome 2 : Plateforme de recherche, du 2018-05-01 au 2019-03-31
  • Caractérisation des signatures cellulaires des infections virales pour identifier des antiviraux contre les paramyxivirus., Subvention, Fondation de l'Université Laval, du 2015-10-01 au 2017-09-30
  • Centre de recherche en infectiologie, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 1996-06-01 au 2019-04-30
  • Centre de recherche sur les données massives (CRDM), Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Cas spéciaux et obligations institutionnelles, du 2015-05-01 au 2017-04-30
  • Chaire de recherche du Canada en génomique médicale, Subvention, Secrétariat des Chaires de recherche du Canada, Chaires de recherche du Canada - Fonctionnement, du 2011-01-01 au 2017-12-31
  • Computational and machine learning approaches to improve design and screening of high bioactivity peptides for drug discovery, Subvention, Consortium québécois sur la découverte du médicament, Concours FOCUS, du 2014-12-01 au 2017-11-30
  • Croissance de Legionella pneumophila dans les systèmes hydriques: comprendre la relation entre son génome et le microbiome., Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Projet de recherche en équipe, du 2015-04-01 au 2018-03-31
  • Evaluation of blood products in health and disease using machine learning and high throughput mass spectrometry, Subvention, MITACS Inc., Converge Project Proposal, du 2016-03-01 au 2019-03-31
  • Infrastructure to Curb Atherosclerosis Through Precision Medicine, Partenariat, Fondation Canadienne pour l'innovation (La), Fonds d'innovation (FI), du 2018-08-15 au 2019-03-31
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval