Arnaud Droit est professeur agrégé au Département de médecine moléculaire de la Faculté de médecine de l’Université Laval, et chercheur au Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, où il dirige la plateforme de bio-informatique et de protéomique. Il est aussi membre du bureau de direction du Centre de recherche en données massives (CRDM) de l’Université Laval. Arnaud Droit a fait ses études en biochimie et en bio-informatique à l’Université Toulouse III – Paul Sabatier, et est détenteur d’un doctorat de l’Université Laval. Le programme de recherche d’Arnaud Droit vise à développer de nouvelles approches et méthodes de génomique computationnelle, afin d’analyser efficacement et rigoureusement les données de génomique et de protéomique issues des technologies de nouvelle génération. Il est ainsi à la croisée des chemins entre les sciences biologiques et informatiques.

Depuis 2016, il est titulaire de la Chaire de recherche et d’innovation L’Oréal en biologie numérique, première chaire de recherche en biologie numérique, qui constitue un pôle d’excellence pour le développement de technologies et d’analyses de données multi-omiques massives (qui incluent les différents champs de la biologie se terminant par le suffixe « omique » : génomique, épigénomique, protéomique, métagénomique, etc.).

Le Dr Droit supervise plusieurs projets d’envergure, dont l’objectif est de résoudre les défis liés à la gestion de données massives et d’en extraire des connaissances exploitables pour la communauté des sciences de la vie. Un de ses projets vise à agréger de nombreuses sources de données biologiques, les relier entre elles, découvrir de nouvelles relations, et les rendre disponibles sur internet via des interfaces de visualisations dynamiques. Il est aussi impliqué dans le développement d’outils d’apprentissage machine dédiés à la recherche clinique et aux données multi-omiques, qui pourront aussi s’étendre dans d’autres domaines. D’autres projets couvrent aussi l’analyse de données multi-omiques temporelles, qui requièrent le développement de nouvelles approches, ou encore l’identification de gènes interagissant ensemble par l’intermédiaire de création de réseaux de co-expression.

Finalement, le Dr Droit a établi de nombreuses collaborations internationales qui lui permettent de couvrir plusieurs champs de recherche en biologie, notamment en oncologie, immunologie, et maladies de la peau.

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Lamontagne-Proulx J, St-Amour I, Labib R, Pilon J, Denis HL, Cloutier N, Roux-Dalvai F, Vincent AT, Mason SL, Duchez AC, Droit A, Lacroix S, Dupre N, Langlois M, Chouinard S, Panisset M, Barker RA, Boilard E, Cicchetti F

Portrait of blood-derived extracellular vesicles in patients with Parkinson's disease.

Article de revue

Neurobiol Dis, 124 , p. 163-175, 2019, ISSN: 0969-9961.

Résumé | Liens:

Belleau P, Deschenes A, Scott-Boyer MP, Dalvai M, Bailey J, Droit A

Inferring and modeling inheritance of differentially methylated changes across multiple generations.

Article de revue

Nucleic Acids Res, 46 (14), p. e85, 2018, ISSN: 0305-1048.

Résumé | Liens:

Belleau P, Deschenes A, Scott-Boyer MP, Lambrot R, Dalvai M, Kimmins S, Bailey J, Droit A

Inferring and modeling inheritance of differentially methylated changes across multiple generations.

Article de revue

Nucleic Acids Res, 46 (14), p. 7466, 2018, ISSN: 0305-1048.

| Liens:

Tourancheau A, Rouleau M, Guauque-Olarte S, Villeneuve L, Gilbert I, Droit A, Guillemette C

Quantitative profiling of the UGT transcriptome in human drug-metabolizing tissues.

Article de revue

Pharmacogenomics J, 18 (2), p. 251-261, 2018, ISSN: 1470-269X.

Résumé | Liens:

Vincent AT, Bourbonnais Y, Brouard JS, Deveau H, Droit A, Gagne SM, Guertin M, Lemieux C, Rathier L, Charette SJ, Lague P

Implementing a web-based introductory bioinformatics course for non-bioinformaticians that incorporates practical exercises.

Article de revue

Biochem Mol Biol Educ, 46 (1), p. 31-38, 2018, ISSN: 1470-8175.

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Aumailley L, Roux-Dalvai F, Kelly I, Droit A, Lebel M

Vitamin C alters the amount of specific endoplasmic reticulum associated proteins involved in lipid metabolism in the liver of mice synthesizing a nonfunctional Werner syndrome (Wrn) mutant protein.

Article de revue

PLoS ONE, 13 (3), p. e0193170, 2018.

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Boutchueng-Djidjou M, Belleau P, Bilodeau N, Fortier S, Bourassa S, Droit A, Elowe S, Faure RL

A type 2 diabetes disease module with a high collective influence for Cdk2 and PTPLAD1 is localized in endosomes.

Article de revue

PLoS ONE, 13 (10), p. e0205180, 2018.

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Milne RL, Kuchenbaecker KB, Michailidou K, Beesley J, Kar S, Lindstrom S, Hui S, Lemacon A, Soucy P, Dennis J, Jiang X, Rostamianfar A, Finucane H, Bolla MK, McGuffog L, Wang Q, Aalfs CM, ABCTB Investigators, Adams M, Adlard J, Agata S, Ahmed S, Ahsan H, Aittomaki K, Al-Ejeh F, Allen J, Ambrosone CB, Amos CI, Andrulis IL, Anton-Culver H, Antonenkova NN, Arndt V, Arnold N, Aronson KJ, Auber B, Auer PL, Ausems MGEM, Azzollini J, Bacot F, Balmana J, Barile M, Barjhoux L, Barkardottir RB, Barrdahl M, Barnes D, Barrowdale D, Baynes C, Beckmann MW, Benitez J, Bermisheva M, Bernstein L, Bignon YJ, Blazer KR, Blok MJ, Blomqvist C, Blot W, Bobolis K, Boeckx B, Bogdanova NV, Bojesen A, Bojesen SE, Bonanni B, Borresen-Dale AL, Bozsik A, Bradbury AR, Brand JS, Brauch H, Brenner H, Bressac-de Paillerets B, Brewer C, Brinton L, Broberg P, Brooks-Wilson A, Brunet J, Bruning T, Burwinkel B, Buys SS, Byun J, Cai Q, Caldes T, Caligo MA, Campbell I, Canzian F, Caron O, Carracedo A, Carter BD, Castelao JE, Castera L, Caux-Moncoutier V, Chan SB, Chang-Claude J, Chanock SJ, Chen X, Cheng TD, Chiquette J, Christiansen H, Claes KBM, Clarke CL, Conner T, Conroy DM, Cook J, Cordina-Duverger E, Cornelissen S, Coupier I, Cox A, Cox DG, Cross SS, Cuk K, Cunningham JM, Czene K, Daly MB, Damiola F, Darabi H, Davidson R, De Leeneer K, Devilee P, Dicks E, Diez O, Ding YC, Ditsch N, Doheny KF, Domchek SM, Dorfling CM, Dork T, Dos-Santos-Silva I, Dubois S, Dugue PA, Dumont M, Dunning AM, Durcan L, Dwek M, Dworniczak B, Eccles D, Eeles R, Ehrencrona H, Eilber U, Ejlertsen B, Ekici AB, Eliassen AH, EMBRACE, Engel C, Eriksson M, Fachal L, Faivre L, Fasching PA, Faust U, Figueroa J, Flesch-Janys D, Fletcher O, Flyger H, Foulkes WD, Friedman E, Fritschi L, Frost D, Gabrielson M, Gaddam P, Gammon MD, Ganz PA, Gapstur SM, Garber J, Garcia-Barberan V, Garcia-Saenz JA, Gaudet MM, Gauthier-Villars M, Gehrig A, GEMO Study Collaborators, Georgoulias V, Gerdes AM, Giles GG, Glendon G, Godwin AK, Goldberg MS, Goldgar DE, Gonzalez-Neira A, Goodfellow P, Greene MH, Alnaes GIG, Grip M, Gronwald J, Grundy A, Gschwantler-Kaulich D, Guenel P, Guo Q, Haeberle L, Hahnen E, Haiman CA, Hakansson N, Hallberg E, Hamann U, Hamel N, Hankinson S, Hansen TVO, Harrington P, Hart SN, Hartikainen JM, Healey CS, HEBON, Hein A, Helbig S

Identification of ten variants associated with risk of estrogen-receptor-negative breast cancer.

Article de revue

Nat Genet, 49 (12), p. 1767-1778, 2017, ISSN: 1061-4036.

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Michailidou K, Lindstrom S, Dennis J, Beesley J, Hui S, Kar S, Lemacon A, Soucy P, Glubb D, Rostamianfar A, Bolla MK, Wang Q, Tyrer J, Dicks E, Lee A, Wang Z, Allen J, Keeman R, Eilber U, French JD, Qing Chen X, Fachal L, McCue K, McCart Reed AE, Ghoussaini M, Carroll JS, Jiang X, Finucane H, Adams M, Adank MA, Ahsan H, Aittomaki K, Anton-Culver H, Antonenkova NN, Arndt V, Aronson KJ, Arun B, Auer PL, Bacot F, Barrdahl M, Baynes C, Beckmann MW, Behrens S, Benitez J, Bermisheva M, Bernstein L, Blomqvist C, Bogdanova NV, Bojesen SE, Bonanni B, Borresen-Dale AL, Brand JS, Brauch H, Brennan P, Brenner H, Brinton L, Broberg P, Brock IW, Broeks A, Brooks-Wilson A, Brucker SY, Bruning T, Burwinkel B, Butterbach K, Cai Q, Cai H, Caldes T, Canzian F, Carracedo A, Carter BD, Castelao JE, Chan TL, David Cheng TY, Seng Chia K, Choi JY, Christiansen H, Clarke CL, NBCS Collaborators, Collee M, Conroy DM, Cordina-Duverger E, Cornelissen S, Cox DG, Cox A, Cross SS, Cunningham JM, Czene K, Daly MB, Devilee P, Doheny KF, Dork T, Dos-Santos-Silva I, Dumont M, Durcan L, Dwek M, Eccles DM, Ekici AB, Eliassen AH, Ellberg C, Elvira M, Engel C, Eriksson M, Fasching PA, Figueroa J, Flesch-Janys D, Fletcher O, Flyger H, Fritschi L, Gaborieau V, Gabrielson M, Gago-Dominguez M, Gao YT, Gapstur SM, Garcia-Saenz JA, Gaudet MM, Georgoulias V, Giles GG, Glendon G, Goldberg MS, Goldgar DE, Gonzalez-Neira A, Grenaker Alnaes GI, Grip M, Gronwald J, Grundy A, Guenel P, Haeberle L, Hahnen E, Haiman CA, Hakansson N, Hamann U, Hamel N, Hankinson S, Harrington P, Hart SN, Hartikainen JM, Hartman M, Hein A, Heyworth J, Hicks B, Hillemanns P, Ho DN, Hollestelle A, Hooning MJ, Hoover RN, Hopper JL, Hou MF, Hsiung CN, Huang G, Humphreys K, Ishiguro J, Ito H, Iwasaki M, Iwata H, Jakubowska A, Janni W, John EM, Johnson N, Jones K, Jones M, Jukkola-Vuorinen A, Kaaks R, Kabisch M, Kaczmarek K, Kang D, Kasuga Y, Kerin MJ, Khan S, Khusnutdinova E, Kiiski JI, Kim SW, Knight JA, Kosma VM, Kristensen VN, Kruger U, Kwong A, Lambrechts D, Le Marchand L, Lee E, Lee MH, Lee JW, Neng Lee C, Lejbkowicz F, Li J, Lilyquist J, Lindblom A, Lissowska J, Lo WY, Loibl S, Long J, Lophatananon A, Lubinski J, Luccarini C, Lux MP, Ma ESK, MacInnis RJ, Maishman T, Makalic E, Malone KE, Kostovska IM, Mannermaa A, Manoukian S

Association analysis identifies 65 new breast cancer risk loci.

Article de revue

Nature, 551 (7678), p. 92-94, 2017, ISSN: 0028-0836.

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Pouliot MC, Kothari C, Joly-Beauparlant C, Labrie Y, Ouellette G, Simard J, Droit A, Durocher F

Transcriptional signature of lymphoblastoid cell lines of BRCA1, BRCA2 and non-BRCA1/2 high risk breast cancer families.

Article de revue

Oncotarget, 8 (45), p. 78691-78712, 2017, ISSN: 1949-2553.

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Projets actifs

  • Calcul Québec, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2015-04-01 au 2021-03-31
  • Cellular mechanisms regulating the pathogenesis of secondary progressive CNS autoimmunity, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention Projet, du 2018-10-01 au 2023-03-31
  • Centre de recherche en données massives, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2016-06-07 au 2021-06-06
  • Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
  • Chaire de recherche et d'innovation l'Oréal en biologie numérique, Subvention, L'Oréal, Chaires de recherche sans organismes subventionnaires, du 2016-05-16 au 2021-05-15
  • Development of Comprehensive Cytogenomics and Molecular Genetics Testing Using ans Exome and Low-Pass Whole Genome Sequencing Combined Approach, Partenariat, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2019-01-01 au 2022-12-31
  • Father's lasting influence:Molecular foundations of intergenerational transmission of the paternal environment, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention d'équipe : La santé des garçons et des hommes, du 2014-11-01 au 2019-10-31
  • Frame shift mutation-induced on the microbiome, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Sentinelle Nord - Projets conjoints avec Université Côte d'Azur / IDEX, du 2018-10-01 au 2019-09-30
  • Identification et quantification de biomarqueurs responsables de l'activité biofongicide et bioinsecticide produites par des souches de Bacillus, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de recherche et développement coopérative (RDC), du 2016-05-10 au 2019-05-09
  • Identifying novel molecular insights from life science massive data, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), du 2018-04-01 au 2023-03-31
  • Impact of the sperm epigenome on the progeny outcome born by assisted reproductive technology, Subvention, Sick Kids Foundation (The), New Investigator Research Grants, du 2016-07-01 au 2019-06-30
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Société et culture, Appel à propositions : création d’un Observatoire international sur les impacts sociétaux de l’intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2024-03-31
  • Personalized Risk Assesment for Prevention and Early Detection of Breast Cancer : Integration and Implementation (PERSPECTIVE II), Subvention, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2017-11-01 au 2022-03-31
  • Toward nutritional and epigenomic interventions in prostate cancer prevention and management, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Fonctionnement: Subvention de promotion de l’impact - CCREES, du 2017-10-01 au 2020-09-30
  • Use of genomics to manage and protect caribou populations, Subvention, Génome Canada, Programme de partenariats pour les applications de la génomique (PPAG), du 2018-04-01 au 2021-03-31

Projets terminés récemment

  • Centre de recherche sur les données massives (CRDM), Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Cas spéciaux et obligations institutionnelles, du 2015-05-01 au 2017-04-30
  • Combination of Wnt-ß-catenin, androgen receptor and PD-1 inhibition for the therapy of bladder cancer, Subvention, Cancer de la vessie Canada, Research Grant Program 2017, du 2018-01-01 au 2018-12-31
  • Dietary microRNAs, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention de fonctionnement, du 2014-07-01 au 2019-03-31
  • Personalized risk stratification for prevention and early detection of breast cancer, Subvention, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2013-04-01 au 2019-03-31
  • Pharmacogenomics of human UDP-glucuronosyltransferases: From single genetic polymorphisms to a complex regulation of enzyme function, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention de fonctionnement, du 2014-04-01 au 2019-03-31
  • Prédisposition, prédiction et prévention du cancer du sein, Subvention, Ministère de l'Économie, de l'Innovation et des Exportations, Programme de soutien à la recherche (PSR-V4) : Programme de soutien à des initiatives internationales de recherche et d'innovation (SIIRI), du 2016-04-01 au 2019-03-31
  • Profilage moléculaire des adénocarcinomes pulmonaires multiples synchrones: Identification de cibles moléculaires potentielles. (fonds 0493), Subvention, Fondation de l'Université Laval, du 2014-11-05 au 2017-12-31
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval