Arnaud Droit est professeur agrégé au Département de médecine moléculaire de la Faculté de médecine de l’Université Laval, et chercheur au Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, où il dirige la plateforme de bio-informatique et de protéomique. Il est aussi membre du bureau de direction du Centre de recherche en données massives (CRDM) de l’Université Laval. Arnaud Droit a fait ses études en biochimie et en bio-informatique à l’Université Toulouse III – Paul Sabatier, et est détenteur d’un doctorat de l’Université Laval. Le programme de recherche d’Arnaud Droit vise à développer de nouvelles approches et méthodes de génomique computationnelle, afin d’analyser efficacement et rigoureusement les données de génomique et de protéomique issues des technologies de nouvelle génération. Il est ainsi à la croisée des chemins entre les sciences biologiques et informatiques.

Depuis 2016, il est titulaire de la Chaire de recherche et d’innovation L’Oréal en biologie numérique, première chaire de recherche en biologie numérique, qui constitue un pôle d’excellence pour le développement de technologies et d’analyses de données multi-omiques massives (qui incluent les différents champs de la biologie se terminant par le suffixe « omique » : génomique, épigénomique, protéomique, métagénomique, etc.).

Le Dr Droit supervise plusieurs projets d’envergure, dont l’objectif est de résoudre les défis liés à la gestion de données massives et d’en extraire des connaissances exploitables pour la communauté des sciences de la vie. Un de ses projets vise à agréger de nombreuses sources de données biologiques, les relier entre elles, découvrir de nouvelles relations, et les rendre disponibles sur internet via des interfaces de visualisations dynamiques. Il est aussi impliqué dans le développement d’outils d’apprentissage machine dédiés à la recherche clinique et aux données multi-omiques, qui pourront aussi s’étendre dans d’autres domaines. D’autres projets couvrent aussi l’analyse de données multi-omiques temporelles, qui requièrent le développement de nouvelles approches, ou encore l’identification de gènes interagissant ensemble par l’intermédiaire de création de réseaux de co-expression.

Finalement, le Dr Droit a établi de nombreuses collaborations internationales qui lui permettent de couvrir plusieurs champs de recherche en biologie, notamment en oncologie, immunologie, et maladies de la peau.

CHUL
2705, boulevard Laurier
R-4720
Québec, Québec
Canada G1V 4G2
CHUL
2705, boulevard Laurier
R-4773
Québec, Québec
Canada G1V 4G2
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Tourancheau A, Rouleau M, Guauque-Olarte S, Villeneuve L, Gilbert I, Droit A, Guillemette C

Quantitative profiling of the UGT transcriptome in human drug-metabolizing tissues.

Article de revue

Pharmacogenomics J, 18 (2), p. 251-261, 2018, ISSN: 1470-269X.

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Vincent AT, Bourbonnais Y, Brouard JS, Deveau H, Droit A, Gagne SM, Guertin M, Lemieux C, Rathier L, Charette SJ, Lague P

Implementing a web-based introductory bioinformatics course for non-bioinformaticians that incorporates practical exercises.

Article de revue

Biochem Mol Biol Educ, 46 (1), p. 31-38, 2018, ISSN: 1470-8175.

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Aumailley L, Roux-Dalvai F, Kelly I, Droit A, Lebel M

Vitamin C alters the amount of specific endoplasmic reticulum associated proteins involved in lipid metabolism in the liver of mice synthesizing a nonfunctional Werner syndrome (Wrn) mutant protein.

Article de revue

PLoS ONE, 13 (3), p. e0193170, 2018.

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Milne RL, Kuchenbaecker KB, Michailidou K, Beesley J, Kar S, Lindstrom S, Hui S, Lemacon A, Soucy P, Dennis J, Jiang X, Rostamianfar A, Finucane H, Bolla MK, McGuffog L, Wang Q, Aalfs CM, ABCTB Investigators, Adams M, Adlard J, Agata S, Ahmed S, Ahsan H, Aittomaki K, Al-Ejeh F, Allen J, Ambrosone CB, Amos CI, Andrulis IL, Anton-Culver H, Antonenkova NN, Arndt V, Arnold N, Aronson KJ, Auber B, Auer PL, Ausems MGEM, Azzollini J, Bacot F, Balmana J, Barile M, Barjhoux L, Barkardottir RB, Barrdahl M, Barnes D, Barrowdale D, Baynes C, Beckmann MW, Benitez J, Bermisheva M, Bernstein L, Bignon YJ, Blazer KR, Blok MJ, Blomqvist C, Blot W, Bobolis K, Boeckx B, Bogdanova NV, Bojesen A, Bojesen SE, Bonanni B, Borresen-Dale AL, Bozsik A, Bradbury AR, Brand JS, Brauch H, Brenner H, Bressac-de Paillerets B, Brewer C, Brinton L, Broberg P, Brooks-Wilson A, Brunet J, Bruning T, Burwinkel B, Buys SS, Byun J, Cai Q, Caldes T, Caligo MA, Campbell I, Canzian F, Caron O, Carracedo A, Carter BD, Castelao JE, Castera L, Caux-Moncoutier V, Chan SB, Chang-Claude J, Chanock SJ, Chen X, Cheng TD, Chiquette J, Christiansen H, Claes KBM, Clarke CL, Conner T, Conroy DM, Cook J, Cordina-Duverger E, Cornelissen S, Coupier I, Cox A, Cox DG, Cross SS, Cuk K, Cunningham JM, Czene K, Daly MB, Damiola F, Darabi H, Davidson R, De Leeneer K, Devilee P, Dicks E, Diez O, Ding YC, Ditsch N, Doheny KF, Domchek SM, Dorfling CM, Dork T, Dos-Santos-Silva I, Dubois S, Dugue PA, Dumont M, Dunning AM, Durcan L, Dwek M, Dworniczak B, Eccles D, Eeles R, Ehrencrona H, Eilber U, Ejlertsen B, Ekici AB, Eliassen AH, EMBRACE, Engel C, Eriksson M, Fachal L, Faivre L, Fasching PA, Faust U, Figueroa J, Flesch-Janys D, Fletcher O, Flyger H, Foulkes WD, Friedman E, Fritschi L, Frost D, Gabrielson M, Gaddam P, Gammon MD, Ganz PA, Gapstur SM, Garber J, Garcia-Barberan V, Garcia-Saenz JA, Gaudet MM, Gauthier-Villars M, Gehrig A, GEMO Study Collaborators, Georgoulias V, Gerdes AM, Giles GG, Glendon G, Godwin AK, Goldberg MS, Goldgar DE, Gonzalez-Neira A, Goodfellow P, Greene MH, Alnaes GIG, Grip M, Gronwald J, Grundy A, Gschwantler-Kaulich D, Guenel P, Guo Q, Haeberle L, Hahnen E, Haiman CA, Hakansson N, Hallberg E, Hamann U, Hamel N, Hankinson S, Hansen TVO, Harrington P, Hart SN, Hartikainen JM, Healey CS, HEBON, Hein A, Helbig S

Identification of ten variants associated with risk of estrogen-receptor-negative breast cancer.

Article de revue

Nat Genet, 49 (12), p. 1767-1778, 2017, ISSN: 1061-4036.

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Michailidou K, Lindstrom S, Dennis J, Beesley J, Hui S, Kar S, Lemacon A, Soucy P, Glubb D, Rostamianfar A, Bolla MK, Wang Q, Tyrer J, Dicks E, Lee A, Wang Z, Allen J, Keeman R, Eilber U, French JD, Qing Chen X, Fachal L, McCue K, McCart Reed AE, Ghoussaini M, Carroll JS, Jiang X, Finucane H, Adams M, Adank MA, Ahsan H, Aittomaki K, Anton-Culver H, Antonenkova NN, Arndt V, Aronson KJ, Arun B, Auer PL, Bacot F, Barrdahl M, Baynes C, Beckmann MW, Behrens S, Benitez J, Bermisheva M, Bernstein L, Blomqvist C, Bogdanova NV, Bojesen SE, Bonanni B, Borresen-Dale AL, Brand JS, Brauch H, Brennan P, Brenner H, Brinton L, Broberg P, Brock IW, Broeks A, Brooks-Wilson A, Brucker SY, Bruning T, Burwinkel B, Butterbach K, Cai Q, Cai H, Caldes T, Canzian F, Carracedo A, Carter BD, Castelao JE, Chan TL, David Cheng TY, Seng Chia K, Choi JY, Christiansen H, Clarke CL, NBCS Collaborators, Collee M, Conroy DM, Cordina-Duverger E, Cornelissen S, Cox DG, Cox A, Cross SS, Cunningham JM, Czene K, Daly MB, Devilee P, Doheny KF, Dork T, Dos-Santos-Silva I, Dumont M, Durcan L, Dwek M, Eccles DM, Ekici AB, Eliassen AH, Ellberg C, Elvira M, Engel C, Eriksson M, Fasching PA, Figueroa J, Flesch-Janys D, Fletcher O, Flyger H, Fritschi L, Gaborieau V, Gabrielson M, Gago-Dominguez M, Gao YT, Gapstur SM, Garcia-Saenz JA, Gaudet MM, Georgoulias V, Giles GG, Glendon G, Goldberg MS, Goldgar DE, Gonzalez-Neira A, Grenaker Alnaes GI, Grip M, Gronwald J, Grundy A, Guenel P, Haeberle L, Hahnen E, Haiman CA, Hakansson N, Hamann U, Hamel N, Hankinson S, Harrington P, Hart SN, Hartikainen JM, Hartman M, Hein A, Heyworth J, Hicks B, Hillemanns P, Ho DN, Hollestelle A, Hooning MJ, Hoover RN, Hopper JL, Hou MF, Hsiung CN, Huang G, Humphreys K, Ishiguro J, Ito H, Iwasaki M, Iwata H, Jakubowska A, Janni W, John EM, Johnson N, Jones K, Jones M, Jukkola-Vuorinen A, Kaaks R, Kabisch M, Kaczmarek K, Kang D, Kasuga Y, Kerin MJ, Khan S, Khusnutdinova E, Kiiski JI, Kim SW, Knight JA, Kosma VM, Kristensen VN, Kruger U, Kwong A, Lambrechts D, Le Marchand L, Lee E, Lee MH, Lee JW, Neng Lee C, Lejbkowicz F, Li J, Lilyquist J, Lindblom A, Lissowska J, Lo WY, Loibl S, Long J, Lophatananon A, Lubinski J, Luccarini C, Lux MP, Ma ESK, MacInnis RJ, Maishman T, Makalic E, Malone KE, Kostovska IM, Mannermaa A, Manoukian S

Association analysis identifies 65 new breast cancer risk loci.

Article de revue

Nature, 551 (7678), p. 92-94, 2017, ISSN: 0028-0836.

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Projets actifs

  • Calcul Québec, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques, du 2015-04-01 au 2021-03-31
  • Centre de recherche en données massives, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2016-06-07 au 2021-06-06
  • Centre hospitalier universitaire de Québec - CHU de Québec-Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
  • Chaire de recherche et d'innovation l'Oréal en biologie numérique, Subvention, L'Oréal, Chaires de recherche sans organismes subventionnaires, du 2016-05-16 au 2021-05-15
  • Combination of Wnt-ß-catenin, androgen receptor and PD-1 inhibition for the therapy of bladder cancer, Subvention, Cancer de la vessie Canada, Research Grant Program 2017, du 2018-01-01 au 2018-12-31
  • Dietary microRNAs, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention de fonctionnement, du 2014-07-01 au 2019-03-31
  • Effect of environmental contaminants and methylome of breast adipose tissue on aromatase inhibitor efficacy in breast cancer, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Volet Projet: Concours pilotes, du 2016-07-01 au 2020-06-30
  • Father's lasting influence:Molecular foundations of intergenerational transmission of the paternal environment, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention d'équipe : La santé des garçons et des hommes, du 2014-11-01 au 2019-10-31
  • Identification et quantification de biomarqueurs responsables de l'activité biofongicide et bioinsecticide produites par des souches de Bacillus, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de recherche et développement coopérative (RDC), du 2016-05-10 au 2019-05-09
  • Identifying novel molecular insights from life science massive data, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), du 2018-04-01 au 2023-03-31
  • Impact of the sperm epigenome on the progeny outcome born by assisted reproductive technology, Subvention, Sick Kids Foundation (The), New Investigator Research Grants, du 2016-07-01 au 2019-06-30
  • Personalized Risk Assesment for Prevention and Early Detection of Breast Cancer : Integration and Implementation (PERSPECTIVE II), Subvention, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2017-11-01 au 2022-03-31
  • Pharmacogenomics of human UDP-glucuronosyltransferases: From single genetic polymorphisms to a complex regulation of enzyme function, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention de fonctionnement, du 2014-04-01 au 2019-03-31
  • Prédisposition, prédiction et prévention du cancer du sein, Subvention, Ministère de l'Économie, de l'Innovation et des Exportations, Programme de soutien à la recherche (PSR-V4) : Programme de soutien à des initiatives internationales de recherche et d'innovation (SIIRI), du 2016-04-01 au 2019-03-31
  • Toward nutritional and epigenomic interventions in prostate cancer prevention and management, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Fonctionnement: Subvention de promotion de l’impact - CCREES, du 2017-10-01 au 2020-09-30

Projets terminés récemment

  • Centre de recherche sur les données massives (CRDM), Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Cas spéciaux et obligations institutionnelles, du 2015-05-01 au 2017-04-30
  • Coupling metabolomic and proteomic approaches in profiling endobiotics metabolism, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), du 2012-04-01 au 2017-03-31
  • Dissecting in vivo the biological role of the polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 (GALNT3) in ovarian cancer cell invasiveness and its possible implication in aberrant O-glycosylation of mucin-like targets., Subvention, Société de recherche sur le cancer, Subvention de fonctionnement, du 2014-09-01 au 2017-02-28
  • Epigenomic control of prostatic inflammation., Subvention, Cancer de la prostate Canada, Subventions d'équipe Movember (Movember Discovery Grants), du 2014-07-01 au 2016-12-31
  • Human and Microbial Integrative Genomics, Partenariat, Fondation Canadienne pour l'innovation (La), Fonds de l'avant-garde (FA), du 2012-09-01 au 2016-08-31
  • Personalized risk stratification for prevention and early detection of breast cancer, Subvention, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2013-04-01 au 2018-03-31
  • Profilage moléculaire des adénocarcinomes pulmonaires multiples synchrones: Identification de cibles moléculaires potentielles. (fonds 0493), Subvention, Fondation de l'Université Laval, du 2014-11-05 au 2017-12-31
  • Soutien aux jeunes professeurs., Subvention, Université Laval - démarrage nouveau chercheur, Soutien facultaire aux jeunes chercheurs de la Faculté de médecine, du 2012-01-01 au 2016-12-31
  • Soutien facultaire aux jeunes professeurs, Subvention, Université Laval - budget de fonctionnement, Bourses pour les nouveaux professeurs chercheurs à la Faculté de médecine, du 2012-01-01 au 2016-12-31
  • WikiTrauma: Implementation and evaluation of a WIKI involving multiple stakeholders including patients in the promotion of best practices in TRAUMA care (an interrupted time series), Subvention, Canadian Medical Protective Association (The), du 2014-11-07 au 2016-06-30
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval