Arnaud Droit est professeur agrégé au Département de médecine moléculaire de la Faculté de médecine de l’Université Laval, et chercheur au Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, où il dirige la plateforme de bio-informatique et de protéomique. Il est aussi membre du bureau de direction du Centre de recherche en données massives (CRDM) de l’Université Laval. Arnaud Droit a fait ses études en biochimie et en bio-informatique à l’Université Toulouse III – Paul Sabatier, et est détenteur d’un doctorat de l’Université Laval. Le programme de recherche d’Arnaud Droit vise à développer de nouvelles approches et méthodes de génomique computationnelle, afin d’analyser efficacement et rigoureusement les données de génomique et de protéomique issues des technologies de nouvelle génération. Il est ainsi à la croisée des chemins entre les sciences biologiques et informatiques.

Depuis 2016, il est titulaire de la Chaire de recherche et d’innovation L’Oréal en biologie numérique, première chaire de recherche en biologie numérique, qui constitue un pôle d’excellence pour le développement de technologies et d’analyses de données multi-omiques massives (qui incluent les différents champs de la biologie se terminant par le suffixe « omique » : génomique, épigénomique, protéomique, métagénomique, etc.).

Le Dr Droit supervise plusieurs projets d’envergure, dont l’objectif est de résoudre les défis liés à la gestion de données massives et d’en extraire des connaissances exploitables pour la communauté des sciences de la vie. Un de ses projets vise à agréger de nombreuses sources de données biologiques, les relier entre elles, découvrir de nouvelles relations, et les rendre disponibles sur internet via des interfaces de visualisations dynamiques. Il est aussi impliqué dans le développement d’outils d’apprentissage machine dédiés à la recherche clinique et aux données multi-omiques, qui pourront aussi s’étendre dans d’autres domaines. D’autres projets couvrent aussi l’analyse de données multi-omiques temporelles, qui requièrent le développement de nouvelles approches, ou encore l’identification de gènes interagissant ensemble par l’intermédiaire de création de réseaux de co-expression.

Finalement, le Dr Droit a établi de nombreuses collaborations internationales qui lui permettent de couvrir plusieurs champs de recherche en biologie, notamment en oncologie, immunologie, et maladies de la peau.

CHUL
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Québec, Québec
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Bianco S, Bellefleur AM, Beaulieu E, Beauparlant CJ, Bertolin K, Droit A, Schoonjans K, Murphy BD, Gevry N

The Ovulatory Signal Precipitates LRH-1 Transcriptional Switching Mediated by Differential Chromatin Accessibility.

Article de revue

Cell Rep, 28 (9), p. 2443-2454.e4, 2019.

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Ross J, Rashkovan M, Fraszczak J, Joly Beauparlant C, Vadnais C, Winkler R, Droit A, Kosan C, Moroy T

Deletion of the Miz-1 POZ Domain Increases Efficacy of Cytarabine Treatment in T- and B-ALL/Lymphoma Mouse Models.

Article de revue

Cancer Res, 79 (16), p. 4184-4195, 2019, ISSN: 0008-5472.

Résumé | Liens:

O'Connor S, Greffard K, Leclercq M, Julien P, Weisnagel SJ, Gagnon C, Droit A, Bilodeau JF, Rudkowska I

Increased Dairy Products Intake Alters Serum Metabolite Profiles in Subjects at Risk of Developing Type 2 Diabetes.

Article de revue

Mol Nutr Food Res, p. e1900126, 2019, ISSN: 1613-4125.

Résumé | Liens:

Poluri RTK, Beauparlant CJ, Droit A, Audet-Walsh E

RNA sequencing data of human prostate cancer cells treated with androgens.

Article de revue

Data Brief, 25 , p. 104372, 2019, ISSN: 2352-3409.

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Luo X, Munoz-Pino E, Francavilla R, Vallee M, Droit A, Topolnik L

Transcriptomic profile of the subiculum-projecting VIP GABAergic neurons in the mouse CA1 hippocampus.

Article de revue

Brain Struct Funct, 224 (6), p. 2269-2280, 2019, ISSN: 1863-2653.

Résumé | Liens:

Lamontagne-Proulx J, St-Amour I, Labib R, Pilon J, Denis HL, Cloutier N, Roux-Dalvai F, Vincent AT, Mason SL, Duchez AC, Droit A, Lacroix S, Dupre N, Langlois M, Chouinard S, Panisset M, Barker RA, Boilard E, Cicchetti F

Portrait of blood-derived extracellular vesicles in patients with Parkinson's disease.

Article de revue

Neurobiol Dis, 124 , p. 163-175, 2019, ISSN: 0969-9961.

Résumé | Liens:

Leclercq M, Vittrant B, Martin-Magniette ML, Scott Boyer MP, Perin O, Bergeron A, Fradet Y, Droit A

Large-Scale Automatic Feature Selection for Biomarker Discovery in High-Dimensional OMICs Data.

Article de revue

Front Genet, 10 , p. 452, 2019, ISSN: 1664-8021.

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Belleau P, Deschenes A, Scott-Boyer MP, Dalvai M, Bailey J, Droit A

Inferring and modeling inheritance of differentially methylated changes across multiple generations.

Article de revue

Nucleic Acids Res, 46 (14), p. e85, 2018, ISSN: 0305-1048.

Résumé | Liens:

Belleau P, Deschenes A, Scott-Boyer MP, Lambrot R, Dalvai M, Kimmins S, Bailey J, Droit A

Inferring and modeling inheritance of differentially methylated changes across multiple generations.

Article de revue

Nucleic Acids Res, 46 (14), p. 7466, 2018, ISSN: 0305-1048.

| Liens:

Tourancheau A, Rouleau M, Guauque-Olarte S, Villeneuve L, Gilbert I, Droit A, Guillemette C

Quantitative profiling of the UGT transcriptome in human drug-metabolizing tissues.

Article de revue

Pharmacogenomics J, 18 (2), p. 251-261, 2018, ISSN: 1470-269X.

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Projets actifs

  • (FRSQ 83876)Targeting PD-1 and TIGIT pathways for the immunotherapy of bladder cancer, Subvention, Association canadienne d'urologie, du 2018-11-23 au 2019-11-22
  • Calcul Québec, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2015-04-01 au 2021-03-31
  • Cellular mechanisms regulating the pathogenesis of secondary progressive CNS autoimmunity, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention Projet, du 2018-10-01 au 2023-03-31
  • Centre de recherche en données massives, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2016-06-07 au 2021-06-06
  • Centres hospitaliers universitaires de Québec - Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
  • Chaire de recherche et d'innovation l'Oréal en biologie numérique, Subvention, L'Oréal, Chaires de recherche sans organismes subventionnaires, du 2016-05-16 au 2021-05-15
  • Development of Comprehensive Cytogenomics and Molecular Genetics Testing Using ans Exome and Low-Pass Whole Genome Sequencing Combined Approach, Partenariat, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2019-01-01 au 2021-12-31
  • Développement d'un nouvel instrument d'analyse en temps réel pour la chirurgie guidée des cancers, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Nouveau programme Samuel-De Champlain, du 2019-04-01 au 2021-03-31
  • Father's lasting influence:Molecular foundations of intergenerational transmission of the paternal environment, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention d'équipe : La santé des garçons et des hommes, du 2014-11-01 au 2019-10-31
  • Frame shift mutation-induced on the microbiome, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Sentinelle Nord - Projets conjoints avec Université Côte d'Azur / IDEX, du 2018-10-01 au 2019-09-30
  • Identification et quantification de biomarqueurs responsables de l'activité biofongicide et bioinsecticide produites par des souches de Bacillus, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de recherche et développement coopérative (RDC), du 2016-05-10 au 2020-03-31
  • Identifying novel molecular insights from life science massive data, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), du 2018-04-01 au 2023-03-31
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Société et culture, Appel à propositions : création d’un Observatoire international sur les impacts sociétaux de l’intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2024-03-31
  • Personalized Risk Assesment for Prevention and Early Detection of Breast Cancer : Integration and Implementation (PERSPECTIVE II), Subvention, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2017-11-01 au 2022-03-31
  • Toward nutritional and epigenomic interventions in prostate cancer prevention and management, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Fonctionnement: Subvention de promotion de l’impact - CCREES, du 2017-10-01 au 2020-09-30
  • Use of genomics to manage and protect caribou populations, Subvention, Génome Canada, Programme de partenariats pour les applications de la génomique (PPAG), du 2018-04-01 au 2021-03-31

Projets terminés récemment

  • Combination of Wnt-ß-catenin, androgen receptor and PD-1 inhibition for the therapy of bladder cancer, Subvention, Cancer de la vessie Canada, Research Grant Program 2017, du 2018-01-01 au 2018-12-31
  • Dietary microRNAs, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention de fonctionnement, du 2014-07-01 au 2019-03-31
  • Impact of the sperm epigenome on the progeny outcome born by assisted reproductive technology, Subvention, Sick Kids Foundation (The), New Investigator Research Grants, du 2016-07-01 au 2019-06-30
  • Pharmacogenomics of human UDP-glucuronosyltransferases: From single genetic polymorphisms to a complex regulation of enzyme function, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention de fonctionnement, du 2014-04-01 au 2019-03-31
  • Prédisposition, prédiction et prévention du cancer du sein, Subvention, Ministère de l'Économie, de l'Innovation et des Exportations, Programme de soutien à la recherche (PSR-V4) : Programme de soutien à des initiatives internationales de recherche et d'innovation (SIIRI), du 2016-04-01 au 2019-03-31
Information provenant du registre des projets de recherche de l'Université Laval