Arnaud Droit est professeur agrégé au Département de médecine moléculaire de la Faculté de médecine de l’Université Laval, et chercheur au Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, où il dirige la plateforme de bio-informatique et de protéomique. Il est aussi membre du bureau de direction du Centre de recherche en données massives (CRDM) de l’Université Laval. Arnaud Droit a fait ses études en biochimie et en bio-informatique à l’Université Toulouse III – Paul Sabatier, et est détenteur d’un doctorat de l’Université Laval. Le programme de recherche d’Arnaud Droit vise à développer de nouvelles approches et méthodes de génomique computationnelle, afin d’analyser efficacement et rigoureusement les données de génomique et de protéomique issues des technologies de nouvelle génération. Il est ainsi à la croisée des chemins entre les sciences biologiques et informatiques.

Depuis 2016, il est titulaire de la Chaire de recherche et d’innovation L’Oréal en biologie numérique, première chaire de recherche en biologie numérique, qui constitue un pôle d’excellence pour le développement de technologies et d’analyses de données multi-omiques massives (qui incluent les différents champs de la biologie se terminant par le suffixe « omique » : génomique, épigénomique, protéomique, métagénomique, etc.).

Le Dr Droit supervise plusieurs projets d’envergure, dont l’objectif est de résoudre les défis liés à la gestion de données massives et d’en extraire des connaissances exploitables pour la communauté des sciences de la vie. Un de ses projets vise à agréger de nombreuses sources de données biologiques, les relier entre elles, découvrir de nouvelles relations, et les rendre disponibles sur internet via des interfaces de visualisations dynamiques. Il est aussi impliqué dans le développement d’outils d’apprentissage machine dédiés à la recherche clinique et aux données multi-omiques, qui pourront aussi s’étendre dans d’autres domaines. D’autres projets couvrent aussi l’analyse de données multi-omiques temporelles, qui requièrent le développement de nouvelles approches, ou encore l’identification de gènes interagissant ensemble par l’intermédiaire de création de réseaux de co-expression.

Finalement, le Dr Droit a établi de nombreuses collaborations internationales qui lui permettent de couvrir plusieurs champs de recherche en biologie, notamment en oncologie, immunologie, et maladies de la peau.

CHUL
2705, boulevard Laurier
Québec, Québec
Canada G1V 4G2
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Jamshidi A, Pelletier JP, Labbe A, Abram F, Martel-Pelletier J, Droit A

Machine learning-based individualized survival prediction model for total knee replacement in osteoarthritis: Data from the Osteoarthritis Initiative.

Article de revue

Arthritis Care Res (Hoboken), 2021.

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Doss PMIA, Umair M, Baillargeon J, Fazazi R, Fudge N, Akbar I, Yeola AP, Williams JB, Leclercq M, Joly-Beauparlant C, Beauchemin P, Ruda GF, Alpaugh M, Anderson AC, Brennan PE, Droit A, Lassmann H, Moore CS, Rangachari M

Male sex chromosomal complement exacerbates the pathogenicity of Th17 cells in a chronic model of central nervous system autoimmunity.

Article de revue

Cell Rep, 34 (10), p. 108833, 2021.

Résumé | Liens:

Ongaro-Carcy R, Scott-Boyer MP, Dessemond A, Belleau F, Leclercq M, Perin O, Droit A

KibioR & Kibio: a new architecture for next-generation data querying and sharing in big biology.

Article de revue

Bioinformatics, 2021, ISSN: 1367-4803.

Résumé | Liens:

Gevariya N, Lachance G, Robitaille K, Joly Beauparlant C, Beaudoin L, Fournier E, Fradet Y, Droit A, Julien P, Marette A, Bergeron A, Fradet V

Omega-3 Eicosapentaenoic Acid Reduces Prostate Tumor Vascularity.

Article de revue

Mol Cancer Res, 19 (3), p. 516-527, 2021, ISSN: 1541-7786.

Résumé | Liens:

Poluri RT, Paquette V, Allain EP, Lafront C, Joly-Beauparlant C, Weidmann C, Droit A, Guillemette C, Pelletier M, Audet-Walsh E

KLF5 and NFYA factors as novel regulators of prostate cancer cell metabolism.

Article de revue

Endocr Relat Cancer, 2021, ISSN: 1351-0088.

Résumé | Liens:

Gravel A, Sanders W, Fournier E, Droit A, Moorman N, Flamand L

Mapping the Human Herpesvirus 6B transcriptome.

Article de revue

J Virol, 2021, ISSN: 0022-538X.

Résumé | Liens:

Milanese JS, Tibiche C, Zaman N, Zou J, Han P, Meng Z, Nantel A, Droit A, Wang E

ETumorMetastasis: A Network-based Algorithm Predicts Clinical Outcomes Using Whole-exome Sequencing Data of Cancer Patients.

Article de revue

Genomics Proteomics Bioinformatics, 2021, ISSN: 1672-0229.

Résumé | Liens:

Khorraminezhad L, Leclercq M, O'Connor S, Julien P, Weisnagel SJ, Gagnon C, Droit A, Rudkowska I

Dairy product intake modifies gut microbiota composition among hyperinsulinemic individuals.

Article de revue

Eur J Nutr, 60 (1), p. 159-167, 2021, ISSN: 1436-6207.

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Silveira MA, Tav C, Berube-Simard FA, Cuppens T, Leclercq M, Fournier E, Cote MC, Droit A, Bilodeau S

Modulating HSF1 levels impacts expression of the estrogen receptor α and antiestrogen response.

Article de revue

Life Sci Alliance, 4 (5), 2021, ISSN: 2575-1077.

Résumé | Liens:

Melki I, Allaeys I, Tessandier N, Mailhot B, Cloutier N, Campbell RA, Rowley JW, Salem D, Zufferey A, Laroche A, Levesque T, Patey N, Rauch J, Lood C, Droit A, McKenzie SE, Machlus KR, Rondina MT, Lacroix S, Fortin PR, Boilard E

FcγRIIA expression accelerates nephritis and increases platelet activation in systemic lupus erythematosus.

Article de revue

Blood, 136 (25), p. 2933-2945, 2020, ISSN: 0006-4971.

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Projets actifs

  • Cellular mechanisms regulating the pathogenesis of secondary progressive CNS autoimmunity, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention Projet, du 2018-10-01 au 2023-03-31
  • Centre de recherche du CHU de Québec - Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
  • Centre de recherche en données massives, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2016-06-07 au 2021-06-06
  • Centre de recherche sur le cancer, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 1996-05-01 au 2022-06-13
  • Chaire de recherche et d'innovation l'Oréal en biologie numérique, Subvention, L'Oréal, Chaires de recherche sans organismes subventionnaires, du 2016-05-16 au 2021-05-15
  • Development of Comprehensive Cytogenomics and Molecular Genetics Testing Using ans Exome and Low-Pass Whole Genome Sequencing Combined Approach, Partenariat, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle - Large-Scale Applied Research Project, du 2019-01-01 au 2021-12-31
  • Father's lasting influence:Molecular foundations of intergenerational transmission of the paternal environment, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention d'équipe : La santé des garçons et des hommes, du 2014-11-01 au 2022-03-31
  • Identifying novel molecular insights from life science massive data, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), du 2018-04-01 au 2023-03-31
  • Impact of the sperm epigenome on the progeny outcome born by assisted reproductive technology, Subvention, Sick Kids Foundation (The), New Investigator Research Grants, du 2016-07-01 au 2021-12-31
  • Leveraging the impact of diversity in neurodevelopmental disability by integrating machine learning in personalized interventions, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Canada-UK Artificial Intelligence Initiative, du 2020-02-01 au 2023-01-31
  • Live viral spectroscopy for rapid Covid-19 detection applied directly to clinical biofluids without sample processing, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions Alliance du CRSNG relatives à la COVID-19, du 2020-08-01 au 2021-07-31
  • Mise en place d’une application web d’aide à la visualisation et à l’interprétation des analyses de la qualité des sols en culture de pommes de terre, Subvention, Ministère de l'agriculture, des pêcheries et de l'alimentation, Programme Innov’Action agroalimentaire, du 2019-05-17 au 2021-05-16
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Société et culture, Appel à propositions : création d’un Observatoire international sur les impacts sociétaux de l’intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2024-03-31
  • Personalized Risk Assesment for Prevention and Early Detection of Breast Cancer : Integration and Implementation (PERSPECTIVE II), Subvention, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle - Large-Scale Applied Research Project, du 2017-11-01 au 2022-03-31

Projets terminés récemment

  • Calcul Québec, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2015-04-01 au 2021-03-31
  • Delineation of the epigenomic principles underlying microglial transcriptional and cellular activity in chronic neurodegenerative diseases, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention Projet, du 2020-03-01 au 2021-02-28
  • Développement d'un nouvel instrument d'analyse en temps réel pour la chirurgie guidée des cancers, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Programme Samuel-De Champlain, du 2019-04-01 au 2021-03-31
  • Frame shift mutation-induced on the microbiome, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Sentinelle Nord - Projets conjoints avec Université Côte d'Azur / IDEX, du 2018-10-01 au 2019-09-30
  • Identification et quantification de biomarqueurs responsables de l'activité biofongicide et bioinsecticide produites par des souches de Bacillus, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de recherche et développement coopérative (RDC), du 2016-05-10 au 2020-03-31
  • Targeting PD-1 and TIGIT pathways for the immunotherapy of bladder cancer, Subvention, Association canadienne d'urologie, du 2018-11-23 au 2019-11-22
  • Toward nutritional and epigenomic interventions in prostate cancer prevention and management, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Fonctionnement: Subvention de promotion de l’impact - CCREES, du 2017-10-01 au 2020-09-30
  • Use of genomics to manage and protect caribou populations, Subvention, Génome Canada, Programme de partenariats pour les applications de la génomique (PPAG), du 2018-04-01 au 2021-03-31
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