Arnaud Droit est professeur agrégé au Département de médecine moléculaire de la Faculté de médecine de l’Université Laval, et chercheur au Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, où il dirige la plateforme de bio-informatique et de protéomique. Il est aussi membre du bureau de direction du Centre de recherche en données massives (CRDM) de l’Université Laval. Arnaud Droit a fait ses études en biochimie et en bio-informatique à l’Université Toulouse III – Paul Sabatier, et est détenteur d’un doctorat de l’Université Laval. Le programme de recherche d’Arnaud Droit vise à développer de nouvelles approches et méthodes de génomique computationnelle, afin d’analyser efficacement et rigoureusement les données de génomique et de protéomique issues des technologies de nouvelle génération. Il est ainsi à la croisée des chemins entre les sciences biologiques et informatiques.

Depuis 2016, il est titulaire de la Chaire de recherche et d’innovation L’Oréal en biologie numérique, première chaire de recherche en biologie numérique, qui constitue un pôle d’excellence pour le développement de technologies et d’analyses de données multi-omiques massives (qui incluent les différents champs de la biologie se terminant par le suffixe « omique » : génomique, épigénomique, protéomique, métagénomique, etc.).

Le Dr Droit supervise plusieurs projets d’envergure, dont l’objectif est de résoudre les défis liés à la gestion de données massives et d’en extraire des connaissances exploitables pour la communauté des sciences de la vie. Un de ses projets vise à agréger de nombreuses sources de données biologiques, les relier entre elles, découvrir de nouvelles relations, et les rendre disponibles sur internet via des interfaces de visualisations dynamiques. Il est aussi impliqué dans le développement d’outils d’apprentissage machine dédiés à la recherche clinique et aux données multi-omiques, qui pourront aussi s’étendre dans d’autres domaines. D’autres projets couvrent aussi l’analyse de données multi-omiques temporelles, qui requièrent le développement de nouvelles approches, ou encore l’identification de gènes interagissant ensemble par l’intermédiaire de création de réseaux de co-expression.

Finalement, le Dr Droit a établi de nombreuses collaborations internationales qui lui permettent de couvrir plusieurs champs de recherche en biologie, notamment en oncologie, immunologie, et maladies de la peau.

CHUL
2705, boulevard Laurier
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Benmoussa A, Laugier J, Beauparlant CJ, Lambert M, Droit A, Provost P

Complexity of the microRNA transcriptome of cow milk and milk-derived extracellular vesicles isolated via differential ultracentrifugation.

Article de revue

J Dairy Sci, 103 (1), p. 16-29, 2020, ISSN: 0022-0302.

Résumé | Liens:

Fachal L, Aschard H, Beesley J, Barnes DR, Allen J, Kar S, Pooley KA, Dennis J, Michailidou K, Turman C, Soucy P, Lemacon A, Lush M, Tyrer JP, Ghoussaini M, Marjaneh MM, Jiang X, Agata S, Aittomaki K, Alonso MR, Andrulis IL, Anton-Culver H, Antonenkova NN, Arason A, Arndt V, Aronson KJ, Arun BK, Auber B, Auer PL, Azzollini J, Balmana J, Barkardottir RB, Barrowdale D, Beeghly-Fadiel A, Benitez J, Bermisheva M, Bialkowska K, Blanco AM, Blomqvist C, Blot W, Bogdanova NV, Bojesen SE, Bolla MK, Bonanni B, Borg A, Bosse K, Brauch H, Brenner H, Briceno I, Brock IW, Brooks-Wilson A, Bruning T, Burwinkel B, Buys SS, Cai Q, Caldes T, Caligo MA, Camp NJ, Campbell I, Canzian F, Carroll JS, Carter BD, Castelao JE, Chiquette J, Christiansen H, Chung WK, Claes KBM, Clarke CL, GEMO Study Collaborators, EMBRACE Collaborators, Collee JM, Cornelissen S, Couch FJ, Cox A, Cross SS, Cybulski C, Czene K, Daly MB, de la Hoya M, Devilee P, Diez O, Ding YC, Dite GS, Domchek SM, Dork T, Dos-Santos-Silva I, Droit A, Dubois S, Dumont M, Duran M, Durcan L, Dwek M, Eccles DM, Engel C, Eriksson M, Evans DG, Fasching PA, Fletcher O, Floris G, Flyger H, Foretova L, Foulkes WD, Friedman E, Fritschi L, Frost D, Gabrielson M, Gago-Dominguez M, Gambino G, Ganz PA, Gapstur SM, Garber J, Garcia-Saenz JA, Gaudet MM, Georgoulias V, Giles GG, Glendon G, Godwin AK, Goldberg MS, Goldgar DE, Gonzalez-Neira A, Tibiletti MG, Greene MH, Grip M, Gronwald J, Grundy A, Guenel P, Hahnen E, Haiman CA, Hakansson N, Hall P, Hamann U, Harrington PA, Hartikainen JM, Hartman M, He W, Healey CS, Heemskerk-Gerritsen BAM, Heyworth J, Hillemanns P, Hogervorst FBL, Hollestelle A, Hooning MJ, Hopper JL, Howell A, Huang G, Hulick PJ, Imyanitov EN, KConFab Investigators, HEBON Investigators, ABCTB Investigators, Isaacs C, Iwasaki M, Jager A, Jakimovska M, Jakubowska A, James PA, Janavicius R, Jankowitz RC, John EM, Johnson N, Jones ME, Jukkola-Vuorinen A, Jung A, Kaaks R, Kang D, Kapoor PM, Karlan BY, Keeman R, Kerin MJ, Khusnutdinova E, Kiiski JI, Kirk J, Kitahara CM, Ko YD, Konstantopoulou I, Kosma VM, Koutros S, Kubelka-Sabit K, Kwong A, Kyriacou K, Laitman Y, Lambrechts D, Lee E, Leslie G, Lester J, Lesueur F, Lindblom A, Lo WY, Long J, Lophatananon A, Loud JT, Lubinski J, MacInnis RJ, Maishman T, Makalic E, Mannermaa A, Manoochehri M

Fine-mapping of 150 breast cancer risk regions identifies 191 likely target genes.

Article de revue

Nat Genet, 52 (1), p. 56-73, 2020, ISSN: 1061-4036.

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Herst PM, Dalvai M, Lessard M, Charest PL, Navarro P, Joly-Beauparlant C, Droit A, Trasler JM, Kimmins S, MacFarlane AJ, Benoit-Biancamano MO, Bailey JL

Folic acid supplementation reduces multigenerational sperm miRNA perturbation induced by in utero environmental contaminant exposure.

Article de revue

Environ Epigenet, 5 (4), p. dvz024, 2019, ISSN: 2058-5888.

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Lessard M, Herst PM, Charest PL, Navarro P, Joly-Beauparlant C, Droit A, Kimmins S, Trasler J, Benoit-Biancamano MO, MacFarlane AJ, Dalvai M, Bailey JL

Prenatal Exposure to Environmentally-Relevant Contaminants Perturbs Male Reproductive Parameters Across Multiple Generations that are Partially Protected by Folic Acid Supplementation.

Article de revue

Sci Rep, 9 (1), p. 13829, 2019, ISSN: 2045-2322.

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Bianco S, Bellefleur AM, Beaulieu E, Beauparlant CJ, Bertolin K, Droit A, Schoonjans K, Murphy BD, Gevry N

The Ovulatory Signal Precipitates LRH-1 Transcriptional Switching Mediated by Differential Chromatin Accessibility.

Article de revue

Cell Rep, 28 (9), p. 2443-2454.e4, 2019.

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Ross J, Rashkovan M, Fraszczak J, Joly Beauparlant C, Vadnais C, Winkler R, Droit A, Kosan C, Moroy T

Deletion of the Miz-1 POZ Domain Increases Efficacy of Cytarabine Treatment in T- and B-ALL/Lymphoma Mouse Models.

Article de revue

Cancer Res, 79 (16), p. 4184-4195, 2019, ISSN: 0008-5472.

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Poluri RTK, Beauparlant CJ, Droit A, Audet-Walsh E

RNA sequencing data of human prostate cancer cells treated with androgens.

Article de revue

Data Brief, 25 , p. 104372, 2019, ISSN: 2352-3409.

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Luo X, Munoz-Pino E, Francavilla R, Vallee M, Droit A, Topolnik L

Transcriptomic profile of the subiculum-projecting VIP GABAergic neurons in the mouse CA1 hippocampus.

Article de revue

Brain Struct Funct, 224 (6), p. 2269-2280, 2019, ISSN: 1863-2653.

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Lamontagne-Proulx J, St-Amour I, Labib R, Pilon J, Denis HL, Cloutier N, Roux-Dalvai F, Vincent AT, Mason SL, Duchez AC, Droit A, Lacroix S, Dupre N, Langlois M, Chouinard S, Panisset M, Barker RA, Boilard E, Cicchetti F

Portrait of blood-derived extracellular vesicles in patients with Parkinson's disease.

Article de revue

Neurobiol Dis, 124 , p. 163-175, 2019, ISSN: 0969-9961.

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Leclercq M, Vittrant B, Martin-Magniette ML, Scott Boyer MP, Perin O, Bergeron A, Fradet Y, Droit A

Large-Scale Automatic Feature Selection for Biomarker Discovery in High-Dimensional OMICs Data.

Article de revue

Front Genet, 10 , p. 452, 2019, ISSN: 1664-8021.

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Projets actifs

  • Calcul Québec, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Regroupements stratégiques NT, du 2015-04-01 au 2021-03-31
  • Cellular mechanisms regulating the pathogenesis of secondary progressive CNS autoimmunity, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention Projet, du 2018-10-01 au 2023-03-31
  • Centre de recherche du CHU de Québec - Université Laval, Subvention, Centre hospitalier universitaire de Québec - Université Laval, Centres de recherche affiliés, du 2017-01-01 au 2099-12-31
  • Centre de recherche en données massives, Subvention, Institutionnel - BDR, BDR - Centres de recherche reconnus, du 2016-06-07 au 2021-06-06
  • Chaire de recherche et d'innovation l'Oréal en biologie numérique, Subvention, L'Oréal, Chaires de recherche sans organismes subventionnaires, du 2016-05-16 au 2021-05-15
  • Development of Comprehensive Cytogenomics and Molecular Genetics Testing Using ans Exome and Low-Pass Whole Genome Sequencing Combined Approach, Partenariat, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2019-01-01 au 2021-12-31
  • Développement d'un nouvel instrument d'analyse en temps réel pour la chirurgie guidée des cancers, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Nouveau programme Samuel-De Champlain, du 2019-04-01 au 2021-03-31
  • Identification et quantification de biomarqueurs responsables de l'activité biofongicide et bioinsecticide produites par des souches de Bacillus, Partenariat, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions de recherche et développement coopérative (RDC), du 2016-05-10 au 2020-03-31
  • Identifying novel molecular insights from life science massive data, Subvention, Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada, Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe), du 2018-04-01 au 2023-03-31
  • Observatoire international sur les impacts sociétaux de l'intelligence artificielle et du numérique, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Société et culture, Appel à propositions : création d’un Observatoire international sur les impacts sociétaux de l’intelligence artificielle et du numérique, du 2018-04-01 au 2024-03-31
  • Personalized Risk Assesment for Prevention and Early Detection of Breast Cancer : Integration and Implementation (PERSPECTIVE II), Subvention, Génome Canada, Projets de recherche appliquée à grande échelle, du 2017-11-01 au 2022-03-31
  • Toward nutritional and epigenomic interventions in prostate cancer prevention and management, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Fonctionnement: Subvention de promotion de l’impact - CCREES, du 2017-10-01 au 2020-09-30
  • Use of genomics to manage and protect caribou populations, Subvention, Génome Canada, Programme de partenariats pour les applications de la génomique (PPAG), du 2018-04-01 au 2021-03-31

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  • (FRSQ 83876)Targeting PD-1 and TIGIT pathways for the immunotherapy of bladder cancer, Subvention, Association canadienne d'urologie, du 2018-11-23 au 2019-11-22
  • Combination of Wnt-ß-catenin, androgen receptor and PD-1 inhibition for the therapy of bladder cancer, Subvention, Cancer de la vessie Canada, Research Grant Program 2017, du 2018-01-01 au 2018-12-31
  • Dietary microRNAs, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention de fonctionnement, du 2014-07-01 au 2019-03-31
  • Father's lasting influence:Molecular foundations of intergenerational transmission of the paternal environment, Subvention, Instituts de recherche en santé du Canada, Subvention d'équipe : La santé des garçons et des hommes, du 2014-11-01 au 2019-10-31
  • Frame shift mutation-induced on the microbiome, Subvention, Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements, Sentinelle Nord - Projets conjoints avec Université Côte d'Azur / IDEX, du 2018-10-01 au 2019-09-30
  • Identify novel molecular insights from life science massive data, Subvention, Fonds de recherche du Québec - Santé, Réseaux thématiques de recherche, du 2018-04-01 au 2018-09-30
  • Impact of the sperm epigenome on the progeny outcome born by assisted reproductive technology, Subvention, Sick Kids Foundation (The), New Investigator Research Grants, du 2016-07-01 au 2019-06-30
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  • Prédisposition, prédiction et prévention du cancer du sein, Subvention, Ministère de l'Économie, de l'Innovation et des Exportations, Programme de soutien à la recherche (PSR-V4) : Programme de soutien à des initiatives internationales de recherche et d'innovation (SIIRI), du 2016-04-01 au 2019-03-31
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